יום שלישי, 29 בדצמבר 2020

פותחים את שנת 2021 עם ערוץ חדש ביוטיוב!

משהו חדש לשנה החדשה: אני שמחה להציג את ערוץ היוטיוב החדש שלי, שבו תוכלו למצוא סרטוני הדרכה על מגוון נושאים וכלים הקשורים למידענות רפואית וחיפוש מידע רפואי. 

לערוץ היוטיוב - מוזמנים להרשם! 

בפלייליסט ראשון בלייב תוכלו למצוא סדרת סרטוני הדרכה בנושאים מגוונים. הסדרה מבוססת על שידורים חיים המתקיימים כל יום ראשון בשעה 21:00. הסרטונים משודרים בלייב בערוץ היוטיוב וגם בפייסבוק בדף שלי ובקהילת לא מחפשים.מוצאים

בנוסף תוכלו למצוא בערוץ סדרה של סרטונים קצרים ושימושיים, וסדרה של הרצאות מתוך מפגשים מדעיים בפורום לתזונת ספורט בניהול גיא שלמון. 

עוד בערוץ סרטונים שאני אוספת עבורכם, למשל סדרת סרטונים על כלים שימושיים של הספריה הלאומית לרפואה בארצות הברית, ה - NLM, וסדרה של סרטוני הדרכה על השימוש בפאבמד, גם כן בעיקר של ה - NLM. 

עוד סרטונים והפתעות צפויים בהמשך, אז מוזמנים להרשם לערוץ ולהיות מעודכנים ראשונים בכל סרטון חדש!

בינתיים אני רוצה לאחל שנת 2021 מוצלחת, הרבה בריאות, ולהשתמע!

אשמח לשמוע מכם הערות והצעות, כולל נושאים לסרטונים שהייתם רוצים לראות, אז תהיו בקשר! אפשר כאן בתגובות או במייל kaminskital@hotmail.com.



יום שישי, 25 בדצמבר 2020

MeSH 2021 כבר כאן! כל מה שצריך לדעת

כמדי שנה בחודש דצמבר מתעדכן מאגר המלים המבוקרות של Medline, הקרוי  MeSH. חשוב לדעת ש - Medline הוא המאגר המרכזי המרכיב את PubMed , לכן חשוב להכיר את המאגר והשינויים החלים בו, היות והם משפיעים על תוצאות החיפוש ב - PubMed. 

מה חדש ב - 2021?

העדכונים לשנת 2021 עומדים, איך לא, בסימן Covid-19. לא פחות מ - 100 מונחים שונים שקשורים לפנדמיה הוספו השנה למאגר. אבל לא רק בנגיף עסקינן, מונחים בתחומים שונים ומשונים ניתן למצוא ברשימה של 277 מונחי MeSH שנוספו למאגר.
המידע המלא מופיע כאן בקישור.

Covid-19

שאלה מעניינת שיכולה לעלות בהקשר זה, אם מעדכנים את מאגר המונחים מדי שנה בדצמבר, האם ייתכן שעד היום לא היו במאגר מונחים על מגיפת הקורונה שהחלה ב - 2019?
כאן המקום לומר שאמנם המונחים הראשיים של המאגר מתעדכנים פעם בשנה, אך קיימים סוגים נוספים של מונחים, המתעדכנים בתדירות גבוהה יותר.
פירוט על סוגי המונחים העיקריים ניתן לראות בתמונה 1:

תמונה 1. סוגים עיקריים של מונחי MeSH

בין המונחים המרכזיים שנוספו למאגר ניתן למנות את:
 
SARS-CoV-2
COVID-19
COVID-19 Testing
COVID-19 Vaccines

לצד מונחים שנכנסו לחיינו דוגמת:
Chain of Infection
Disease Hotspot
N95 Respirators
Pangolins
Physical Distancing
Teleworking

פרוייקטים מיוחדים

בנוסף ל - Covid -19 עודכנו השנה מונחים במספר תחומים, או פרוייקטים מיוחדים כפי שהם נקראים:

Behavioral and Social Science 

Economic Factors
Gender Equity
Social Cognition
Social Factors
Social Inclusion
Social Interaction

New Cardiovascular Headings

Aortic Valve Disease
Aortico-Ventricular Tunnel
Bicuspid Aortic Valve Disease
Cardiac Papillary Fibroelastoma
Hemorrhagic Stroke
Ischemic Stroke
Thrombotic Stroke


New Food and Beverage Headings

Food Deserts
Food Insecurity
Food Security
Sustenance
Water Insecurity

New Infection Headings

Bacterial Zoonoses
Blood-Borne Infections
HIV Testing
Latent Infection
Reinfection
Viral Zoonoses


ולסיום עוד כמה מונחים שנוספו השנה ונראים לי מעניינים ו/או שימושיים:


Internet Use 
Freedom of Movement
Jails
Pseudoscience 
Cardiometabolic Risk Factors
Heart Disease Risk Factors 
Caregiver Burden 
Compulsive Exercise
Glycemic Control 
Resistant Starch
Supermarkets
Team Sports
Waiting Rooms 


כל מונח שהוסף מאפשר חיפוש טוב יותר וממוקד יותר של הנושא בו הוא עוסק. על מנת לקבל את התוצאות הטובות ביותר לחיפוש בפאבמד מומלץ לכתוב את מונח החיפוש בתיבת החיפוש של המאגר בצורה בה הוא מופיע ב - MeSH
למידע והסברים נוספים ניתן לצפות בסרטון על עדכוני MeSH לשנת 2021 שהוקלט במסגרת סדרת השידורים החיים "ראשון בלייב", המתקיימת מדי יום ראשון בשעה 21:00 בשידור חי בערוץ היוטיוב שלי. 



יום שני, 21 בדצמבר 2020

תוספים מבוססי מדע לחיזוק הדפדפן

תוספים לדפדפן הם דרך נפלאה להעשיר את הדפדפן בתכונות ויכולות שיעזרו לנו בעבודה היומיומית. אם אתם קוראים מאמרים מדעיים, כותבים מאמרים מדעיים או מחפשים מאמרים מדעיים, הכנתי לכם רשימה של תוספים שכדאי לכם לשקול בחיוב להוסיף לדפדפן שלכם. כל התוספים מתאימים לדפדפן כרום, וחלקם גם לדפדפנים נוספים.  

התוסף רב הפעלים - התוסף לדפדפן של גוגל סקולר

התוסף של Google Scholar קיבל עדכון גרסה לכבוד יום הולדתו החמישי בספטמבר 2020, וכעת ניתן לעשות באמצעותו כמעט כל מה שניתן לעשות גם מהאתר עצמו, מכל דף אינטרנט שבו נמצאים. בלחיצה על התוסף ניתן לעשות חיפוש, לנסות לאתר טקסט מלא של מאמר, לקבל ציטוט מעוצב, לחזור לחיפוש קודם, לראות מי ציטט את המאמר, לחפש מאמרים דומים ועוד. 

לאחר העדכון החדש ניתן לשמור ישירות מהתוסף מאמרים לספריה האישית ב - Google Scholar, וגם לגשת לספריה האישית. בנוסף, גם בקריאת קובץ PDF מהרשת Google Scholar יזהה את המאמר באתר ויאפשר שמירה שלו, קבלת ציטוט, חיפוש מאמרים דומים ועוד. דבר נוסף שיש בגרסה החדשה הוא כפתור חזרה לדף קודם. 

מידע נוסף על העדכון לתוסף ניתן לקרוא בפוסט מהבלוג של  Google Scholar בנושא.

לדעתי תוסף מאוד שימושי, ששווה להתקין אם הוא עוד לא נמצא בדפדפן שלכם (כרום או פיירפוקס). להתקנה בכרום לחצו כאן.

תמונה 1: Google Scholar

עוד סקולר לרשימה - התוסף של סמנטיק סקולר

במנוע החיפוש Semantic Scholar השיקו לראשונה תוסף לדפדפן, שמקצר את הדרך לאתר מכל דף אינטרנט שבו תהיו. התוסף בגרסתו הראשונה מספק תכונות בסיסיות יחסית לתוסף של Google Scholar: מסמנים קטע מטקסט או כותרת מאמר שפתוח בדפדפן, והתוסף מאפשר לבצע חיפוש עם המקטע המסומן ישירות ב - Semantic Scholar או למצוא את המאמר באתר. לאחר שמגיעים לאתר ניתן לשמור את המאמר בספריה האישית, ליצור Feed מותאם אישית ממנו, וכל יתר התכונות שמציע Semantic Scholar. בחלק מהמקרים לא נדרש לסמן את הכותרת על מנת שהתוסף יזהה אותה, למשל ב - PubMed, ובחלק מהמקרים חייבים לסמן את הכותרת לצורך זיהוייה. 

את ההודעה על ההשקה ניתן לראות כאן. סביר להניח שנראה תכונות נוספות לכלי הזה בהמשך. גם את הגרסה הראשונה שווה להתקין כדי להגיע למאמרים/ליצור חיפושים בקליק ב - Semantic Scholar. להתקנת התוסף לכרום לחצו כאן

תמונה 2: Semantic Scholar

EndNote Click - התוסף שימצא לכם טקסט מלא

EndNote Click הוא תוסף חינמי לאיתור טקסט מלא, וכן ארגון המידע והכנתו לציטוט, כלומר מסייע בתהליך העבודה האקדמי/מדעי. התוסף הושק בשנת 2017 בשם Kopernio על ידי המפתחים יאן רייכלט (Mendeley Co-Founder) ובן קאוב (Newsflo Co-founder). בשנת 2018 נרכש הכלי על ידי חברת Clarivate Analytics תמורת 3.5 מליון פאונד, ובאוקטובר 2020 - החליף שם ל - EndNote Click. 

איך זה עובד?

מתקינים את התוסף, שמתאים לדפדפני כרום, פיירפוקס, אופרה, Edge. יוצרים חשבון, ומכניסים פרטי גישה מוסדיים (אם יש ואם המוסד מופיע ברשימה). לא ניתן להרשם ליותר ממוסד אחד בחשבון אחד. ל - EndNote Click אינטגרציה עם מעל 20,000 אתרים אקדמיים (דוגמת PubMed) ושיתוף פעולה עם מעל 750,000 מוסדות אקדמיים. 
באתרים בהם יש אינטגרציה עם התוסף, התוסף בודק באופן אוטומטי קודם גישה מוסדית ולאחר מכן גישה חופשית, כך שבכל מקום (כמעט) ברשת שתהיו – תוכלו לקבל טקסט מלא בקליק (ראו תמונה 3). איפה לא תקבלו את השירות? בגוגל סקולר, שכנראה לא אהבו את התחרות וחסמו את הגישה לתוסף.

תמונה 3. כך נראה הקישור לטקסט המלא עם  EndNote Click בפאבמד (האייקון הסגול)


מה עוד נותן EndNote Click?

את המאמרים בטקסט מלא שמוצאים אפשר להוריד ו/או לשמור בספריה אישית בענן. אם מצרפים עוד משתמש לכלי מגדילים את שטח האחסון מ - 100MB ל - 2000MB, ומקבלים אינטגרציה עם Dropbox (חשבון פרימיום). אם יש לכם EndNote – תוכלו לשמור מאמרים ישירות מהתוסף לתוכנה. עבור תוכנות אחרות ניתן להוריד קובץ מתאים להוספה ידנית.

בלחיצה על התוסף עצמו, בדף תוצאות חיפוש שבו מאמר אחד או מספר מאמרים (ראו תמונה 4),  יש אפשרות להוריד מספר קבצים בבת אחת, לקבל מידע על כל מאמר כולל מספר הציטוטים מ – WOS Core Collection, לייצא לתוכנה לניהול ציטוטים ולקבל גישה מהירה להגדרות החשבון והאחסון האישי. כמו כן יש אפשרות לחיפוש מהיר במנוע חיפוש לפי בחירה – WOS, PubMed, Google Scholar (הבחירה היא בהגדרות האישיות). 

תמונה 4. החלון המתקבל בלחיצה על התוסף עצמו בדף תוצאות חיפוש 

להתקנת התוסף לכרום לחצו כאן.
ל - EndNote Click היתה אינטגרציה עם הכלי לגילוי מידע מדעי Meta. אולם מחודש נובמבר 2020 שיתוף הפעולה בין שני הכלים פסק. 

אם מענין אתכם להשוות בין EndNote Click לכלים דומים בשוק כאן הכינו לכם השוואה מפורטת.

PubPeer - התוסף שיעשה לכם Post Publication Peer Review

התוסף של PubPeer מאפשר לראות הערות שניתנו על מאמרים מדעיים לאחר פרסומם. לדבר זה ישם כיום אולי יותר מתמיד חשיבות רבה, היות ובתקופת פנדמיה התהליך של בקרת עמיתים טרם הפרסום הוא מזורז מאוד עד לא קיים. 
למידע מלא על PubPeer לחצו כאן
להתקנת התוסף של PubPeer לדפדפנים Chrome, Firefox, Safari, Edge  לחצו כאן.

PubPeer 

!Altmetric It

מדדי ה - Aitmetrics  הם מדדים אלטרנטיביים לאלו המסורתיים, המבוססים על ציטוטים בכתבי עת אקדמיים אחרים, לבדיקת מידת ההשפעה של מאמר מסוים. הם מציגים מידע על השפעת המאמר במקומות רבים, דוגמת רשתות חברתיות, בלוגים, אתרי חדשות, סרטונים, מסמכי מדיניות ממשלתיים ועוד.  תוסף שימושי מאוד של חברת Altmetric מאפשר לקבל מידע מלא על נתוני ה - Aitmetrics של כל מאמר ברשת בלחיצת כפתור. התוסף הוא חינמי, איך ניתן להתקין אותו רק אם יש לכם כתובת דוא"ל מוסדית כלשהי (של אוניברסיטה/בי"ח וכדומה). להתקנה בדפדפנים Chrome, Firefox, Safari לחצו כאן

!Altmetric It


CoCites - התוסף שיעשה לכם סקירת ספרות

CoCites הוא תוסף חדשני (מתאים לדפדפנים Chrome, Firefox, Safari, להתקנה ב - Chrome לחצו כאן) המבצע סקירת ספרות בשיטה שונה מזו המוכרת לנו, המבוססת על מילות מפתח. השיטה של Cocites מבוססת על הדמון בין מאמרים המצוטטים ביחד מספר פעמים במאמרים שונים. ההנחה היא שאם הם מצוטטים ביחד - הם כנראה באותו נושא.  למידע נוסף על CoCites כולל סרטוני הדרכה לחצו כאן


https://www.cocites.com/


אשמח לשמוע מכם, אם התקנתם את התוספים, והאם הם מועילים בעיניכם!

יום חמישי, 10 בדצמבר 2020

CoCites - אמור לי מי ציטט אותך ואומר לך מי אתה

התוסף CoCites (להתקנה - לחצו כאן) הוא תוסף חדש לדפדפן, ייעודי לפאבמד, המציג שיטה חדשה לחיפוש מאמרים. בנוסף, ניתן לומר שהוא מוסיף לפאבמד מידע שכד כה לא היה ניתן למצוא בו בצורה ישירה- מספר הציטוטים של כל מאמר. אם כי הוא עדין אינו מראה מי הם המאמרים הללו. קיים נכון להיום לדפדפני כרום, פיירפוקס וספארי.

את התוסף יצרה ד"ר A. Cecile J.W. Janssens. ד"ר Janssens במקור מהולנד, וכעת חוקרת במחלקה לאפידמיולוגיה בבית הספר לבריאות הציבור באוניברסיטת Emory באטלנטה, ארה"ב. עוסקת במחקר בנושא ניבוי גנטי של מחלות. אז איך הגיעה ד"ר Janssens לפיתוח CoCites? לפי מה שהיא מספרת - במקרה!

https://www.cocites.com/

איך זה עובד?

הרעיון עליו מבוססת שיטת הפעולה של התוסף הוא שמאמרים המצוטטים יחד הם מאמרים באותו נושא או נושא דומה. בעת לחיצה על הכפתור המיוחד שנמצא ליד כל מאמר בדף התוצאות של פאבמד עם השימוש בתוסף, נסרקות רשימות הרפרנסים של כל המאמרים המצטטים את המאמר הנבחר. לאחר מכן מוצגת רשימת המאמרים שצוטטו יחד עם מאמר הבסיס (המאמר שעל הכפתור שלידו לחצנו, והוא הבסיס לחיפוש). ככל שהמאמרים צוטטו ביחד יותר פעמים הדמיון ביניהם גבוה יותר. 

אפשרויות נוספות שמציע הכלי, הפתוחות בחינם למי שרושם לפחות משתמש נוסף אחד לאתר נכון להיום:

אפשרות להוריד קובץ אקסל עם התוצאות

אפשרות לחפש עם יותר ממאמר בסיס אחד

אפשרות לסנן את תוצאות החיפוש לפי מידת הדמיון בין המאמרים ולפי מאמרים חדשים יותר

אפשרות לשמור חיפושים

יתרונות וחסרונות

יתרונות

פועל במהירות יחסית לכלים דומים, וכן נמצא כבר בפאבמד ואין צורך לפתוח אתר נוסף כדי להשתמש בו. 
מוסיף מידע על ציטוטים ישירות לפאבמד, מידע שלא קיים בפאבמד בצורה ישירה ללא התוסף.
מציע שיטת חיפוש יעילה ומהירה, שאינה מבוססת על איתור מילות מפתח, דבר שדורש זמן ומיומנות ולעתים לא קל להגדרה. 

חסרונות

פועל רק על מאמרים שכבר צוטטו, ובצורה מיטבית על מאמרים שצוטטו לפחות 20 פעמים. לכן לא מתאים לחיפוש המבוסס על מאמרים חדשים. 
לא מתאים לחיפושים רב תחומיים - עובד רק על פאבמד, הממוקד בתחום הביו-רפואי. 
הורדת תוצאות רק לאקסל נכון להיום.
לא ניתן (נכון לעכשיו?) לראות את רשימת המאמרים המצטטים אלא רק את מספרם.
לקבלת אפשרות מלאה של חיפוש יש להזמין אחרים להרשם עם לינק ייחודי למשתמש.

מידע נוסף

התוסף פורסם לראשונה בנובמבר 2019, ונכון להיום עדין בגרסת Beta. מקור המידע לגבי הציטוטים עליו מתבסס התוסף הוא מקור חדש חופשי לשימוש NIH Open Citation Collection OCC. עוד על הכלי והשוואה לכלים דומים ניתן לקרוא בבלוג של Aaron Tay, ספרן ובלוגר מסינגפור. 

סרטוני הדרכה

לצפיה בסרטון הדרכה קצר על השימוש בכלי לחצו כאן

להדרכה מפורטת יותר על הכלי לחצו כאן

לסיכום

לדעתי כלי שימושי מאוד, נסו ועדכנו מה דעתכם!