‏הצגת רשומות עם תוויות MESH. הצג את כל הרשומות
‏הצגת רשומות עם תוויות MESH. הצג את כל הרשומות

יום שישי, 25 בדצמבר 2020

MeSH 2021 כבר כאן! כל מה שצריך לדעת

כמדי שנה בחודש דצמבר מתעדכן מאגר המלים המבוקרות של Medline, הקרוי  MeSH. חשוב לדעת ש - Medline הוא המאגר המרכזי המרכיב את PubMed , לכן חשוב להכיר את המאגר והשינויים החלים בו, היות והם משפיעים על תוצאות החיפוש ב - PubMed. 

מה חדש ב - 2021?

העדכונים לשנת 2021 עומדים, איך לא, בסימן Covid-19. לא פחות מ - 100 מונחים שונים שקשורים לפנדמיה הוספו השנה למאגר. אבל לא רק בנגיף עסקינן, מונחים בתחומים שונים ומשונים ניתן למצוא ברשימה של 277 מונחי MeSH שנוספו למאגר.
המידע המלא מופיע כאן בקישור.

Covid-19

שאלה מעניינת שיכולה לעלות בהקשר זה, אם מעדכנים את מאגר המונחים מדי שנה בדצמבר, האם ייתכן שעד היום לא היו במאגר מונחים על מגיפת הקורונה שהחלה ב - 2019?
כאן המקום לומר שאמנם המונחים הראשיים של המאגר מתעדכנים פעם בשנה, אך קיימים סוגים נוספים של מונחים, המתעדכנים בתדירות גבוהה יותר.
פירוט על סוגי המונחים העיקריים ניתן לראות בתמונה 1:

תמונה 1. סוגים עיקריים של מונחי MeSH

בין המונחים המרכזיים שנוספו למאגר ניתן למנות את:
 
SARS-CoV-2
COVID-19
COVID-19 Testing
COVID-19 Vaccines

לצד מונחים שנכנסו לחיינו דוגמת:
Chain of Infection
Disease Hotspot
N95 Respirators
Pangolins
Physical Distancing
Teleworking

פרוייקטים מיוחדים

בנוסף ל - Covid -19 עודכנו השנה מונחים במספר תחומים, או פרוייקטים מיוחדים כפי שהם נקראים:

Behavioral and Social Science 

Economic Factors
Gender Equity
Social Cognition
Social Factors
Social Inclusion
Social Interaction

New Cardiovascular Headings

Aortic Valve Disease
Aortico-Ventricular Tunnel
Bicuspid Aortic Valve Disease
Cardiac Papillary Fibroelastoma
Hemorrhagic Stroke
Ischemic Stroke
Thrombotic Stroke


New Food and Beverage Headings

Food Deserts
Food Insecurity
Food Security
Sustenance
Water Insecurity

New Infection Headings

Bacterial Zoonoses
Blood-Borne Infections
HIV Testing
Latent Infection
Reinfection
Viral Zoonoses


ולסיום עוד כמה מונחים שנוספו השנה ונראים לי מעניינים ו/או שימושיים:


Internet Use 
Freedom of Movement
Jails
Pseudoscience 
Cardiometabolic Risk Factors
Heart Disease Risk Factors 
Caregiver Burden 
Compulsive Exercise
Glycemic Control 
Resistant Starch
Supermarkets
Team Sports
Waiting Rooms 


כל מונח שהוסף מאפשר חיפוש טוב יותר וממוקד יותר של הנושא בו הוא עוסק. על מנת לקבל את התוצאות הטובות ביותר לחיפוש בפאבמד מומלץ לכתוב את מונח החיפוש בתיבת החיפוש של המאגר בצורה בה הוא מופיע ב - MeSH
למידע והסברים נוספים ניתן לצפות בסרטון על עדכוני MeSH לשנת 2021 שהוקלט במסגרת סדרת השידורים החיים "ראשון בלייב", המתקיימת מדי יום ראשון בשעה 21:00 בשידור חי בערוץ היוטיוב שלי. 



יום שבת, 18 באפריל 2020

יש כימיה - PubChem - לא לכימאים בלבד!

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

PubChem הוא מאגר המידע בגישה חופשית הגדול בעולם בנושא כימיה, המנוהל על ידי הספריה הלאומית לרפואה בארה"ב והושק ב - 2004. כמובן שכימאים ימצאו פה מידע מקצועי רב, אבל לא חייבים להיות כימאים כדי ליהנות מהמאגר. המידע כאן הוא רב ומגוון, כפי שניתן ללמוד מדף הסטטיסטיקה
מעל 100 מליון תרכובות, מעל 250 מליון חומרים, מעל 30 מליון מאמרים מדעיים ומעל 3 מליון פטנטים.
דוגמה לחומרים שניתן למצוא עליהם כאן מידע מפורט - תרופות, ויטמינים, פפטידים, שומנים, פחמימות ונוקלאוטידים.
לסרטון קצר המתאר את מאגר PubChem  לחצו כאן

מה באתר?

במרץ 2019 עבר האתר מתיחת פנים ומאז נוספו לו עוד כלים ומקורות מידע. לאתר אין אפליקציה ייעודית למכשירים ניידים, אך הוא רספונסיבי ומתאים לשימוש בכל מכשיר.
לכל חומר או תרכובת באתר ניתן למצוא מידע רב המפורט ומסודר בתפריט הצד המאפשר ניווט נוח למידע הרצוי. למשל לדוגמה בערך על אספירין.

אספירין מקור

מה בתפריט?

בתפריט הצד של כל ערך (מודגש בצהוב בתמונה לעיל) ניתן למצוא מידע רב. כמה דגשים שימושיים:
בסעיף Names & Identifiers ניתן למצוא רשימת מלים נרדפות מ - MeSH אך גם ממקורות נוספים. מתאים לחיפושים מורכבים ויסודיים דוגמת סקירות שיטתיות ומטא-אנליזות. לדוגמא רשימת המלים הנרדפות שאינן מ - MeSH עבור אספירין
בסעיף Drug & Medication Information יש מידע רב מאוד: החל מאינדיקציות לשימוש בתרופה, מידע על רעילות לכבד, דפי המידע של התרופה, ניסויים קליניים בתרופה ממספר מקורות ועוד.
בסעיף Toxicity ניתן למצוא מידע גם על רעילות סביבתית ואקולוגית.
בסעיף Literature ניתן למצוא מידע ממקורות ספרות שונים, וגם חיפושים מוכנים וממוקדים ב - PubMed. 

מה חדש?

הטבלה המחזורית

בשנת 2019 מלאו 150 שנה לגילוי הטבלה המחזורית על ידי מנדלייב, והשנה הוכרזה על ידי הקהילה המדעית כ"שנה הבינלאומית של הטבלה המחזורית". ב - PubChem השיקו לרגל האירוע את הטבלה המחזורית האינטראקטיבית ודפי המידע על היסודות המרכיבים אותה.
לטבלה המחזורית באתר שלוש אפשרויות תצוגה: כטבלה, כרשימת יסודות או כמשחק לבחינת הידע. לחיצה על שם היסוד מציגה מידע מקוצר, ולחיצה נוספת על הקישור המצורף מביאה לדף מידע הכולל מידע מפורט יותר. מתאים במיוחד כשצריך מידע ממוקד על אחד או יותר מהיסודות המופיעים בטבלה.


הטבלה המחזורית 


Pathway Pages

במרץ השנה הוספו לאתר Pathway Pages, שבהם תיאור מפורט של תהליכים כימיים וביולוגיים בהם מעורבים התרכובות והחומרים שבמאגר. המידע נאסף ממספר מקורות אל PubChem. בחלק ממקורות אלה גם ניתן להוריד תרשים של התהליך ואף לערוך אותו לפני כן על פי הצורך. מתאים במיוחד למרצים ולסטודנטים, להכנת עבודות ומצגות. יש לשים לב לזכויות היוצרים של כל תמונה כמפורט במקור. בד"כ חופשי לשימוש תוך מתן קרדיט. תמונה לדוגמה - מטבוליזם ויטמינים מסיסי שומן:


מטבוליזם ויטמינים מסיס שומן. מקור


פטנטים: אינטגרציה עם WIPO

עוד חידוש שהוסף במרץ השנה הוא אינטגרציה עם המידע הקיים באתר
 World Intellectual Property Organization WIPO. בכך ניתן למצוא ביתר קלות פטנטים המקושרים לחומר הכימי הרלוונטי. 

לסיכום

PubChem מסתמן כמקור מידע רב פנים ושימושי, וממש לא לכימאים בלבד. כמו כן נראה שהוא בתנופת שיפורים, מענין לראות מה יתחדש עוד בהמשך.

יום שבת, 25 בינואר 2020

MeSH 2020 - כל העדכונים!


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

כמדי שנה, מונחי MeSH, המונחים מהם בונים את האינדקס של Medline, עוברים עדכון, שינוי והתאמה.  אותי תמיד מענין לראות את העדכונים הללו, המשקפים במידה רבה את המגמות והחידושים בעולם הביו-רפואי. ולמה זה שימושי? באמצעות מונחים אלה מתארים את אנשי המקצוע (ה - Indexers) בספריה הלאומית לרפואה בארצות הברית (NLM) את המאמרים החדשים הנכנסים ל - Medline, כך שיקל עלינו לאתרם על פי משמעותם בעת החיפוש במאגר. במלים אחרות, מונחים אלה משמשים כמעין "האשטגים" על כל מאמר. ניתן להשתמש במונחים הללו גם כדי ליצור התראה על מאמרים חדשים שנכנסים ל - Medline בנושאים שמעניינים אותנו. אז מה התחדש ב - 2020?

קצת מספרים

97 מונחי MeSH ראשיים (Headings) שונו או הוסרו. הרשימה המלאה כאן בקישור
293 מונחי MeSH ראשיים חדשים הוספו, וכן 2 סוגי פרסומים Publication Types. הרשימה המלאה כאן בקישור

חידושים מעניינים

ברשימת המונחים החדשים אפשר לראות מספר קבוצות, המשקפות פרויקטים עליהם עובדים ב - NLM. את העדכון המלא על הפרויקטים הללו ניתן לראות כאן.

פרויקט מונחים בתחום המזון

במונחים החדשים בתחום המזון ניתן לראות הגדרה כוללת של חלבון מהחי, מה שיכול לסייע בחיפושים המבדילים בין חלבון מהחי וחלבון מהצומח. מתאים למגמה הגוברת של תזונה מבוססת מזון מהצומח בהיבטים בריאותיים וסביבתיים. מונחים ייחודיים הוספו גם למשקאות ממותקים בסוכר או בממתיקים מלאכותיים, ובהמשך למחקר הענף ולסטארטאפים הרבים העוסקים בשילוב חרקים בתפריט - נוסף המונח המתבקש Edible Insects.

Animal Proteins, Dietary
Artificially Sweetened Beverages
Edible Insects
Pork Meat
Salads
Sugar-Sweetened Beverages

פרויקט מונחים מתחום הפסיכיאטריה והפסיכולוגיה

מונחים חשובים הוספו בתחום הפרעות אכילה מסוגים שונים, כולל אכילה בררנית, דיאבולימיה ודימוי גוף.

Avoidant Restrictive Food Intake Disorder
Body Dissatisfaction
Body Integrity Identity Disorder
Diabulimia
Emotional Regulation
Food Fussiness with an entry term of Picky Eating
Psychological Distress
Suicide, Completed

מונחים נוספים

מספר מונחים נוספים מעניינים נכנסו השנה לרשימה:
ברוח הזמן נכנסו המונחים- 
Blockchain, Data Management, Disruptive Technology,  Internet-Based Intervention
משבר האקלים והסביבה הביא את המונחים  Exposome , Microplastics, Extreme Weather 
בתחום הספורט  Para-Athletes , Relative Energy Deficiency in Sport 
בתחום ההשמנה Obesity, Maternal ,  Weight Prejudice
בתחום הפרעות אכילה וגסטרו Rumination Syndrome
ובתחום האנקדוטות לסיום: משהו חיובי Psychology, Positive  משהו בריא Pomegranate וכוסות רוח למת מישהו? Cupping Therapy.

למידע נוסף : סרטון הדרכה  חדש המסביר באופן כללי על MeSH  (שעה ועשרים דקות)

יום רביעי, 30 בינואר 2019

MeSH: גרסת 2019

כמדי שנה מתעדכן מאגר המלים המבוקרות המשמש ליצירת האינדקס של מדליין - הלא הוא MeSH. תמיד מענין לצלול לתוך רשימת המונחים החדשים שנוספו, ולקבל אגב כך מושג על מגמות בספרות הרפואית.
 את הפירוט המלא של כל השינויים שחלו במאגר MeSH  לשנת 2019 ניתן לראות כאן.

MeSH Database

מה חדש במונחי MeSH? הצצה

להלן טעימה מתוך 421 המונחים החדשים שנוספו לרשימה השנה, ותפסו את עיני (מסודרים בסדר אלפביתי):

Adverse Childhood Experiences 
Aggressive Driving

Big Data
Body-Weight Trajectory 
Built Environment 
Burnout, Psychological

Change Management

Endurance Training 
Eucalyptus Oil 
Ex-Smokers 

Fish Proteins, Dietary
Fruit Proteins

Gestational Weight Gain
Grain Proteins
Gray Literature

Healthcare-Associated Pneumonia
Host Microbial Interactions

Internet Access

Lycopene

Meat Proteins 

Natural Disasters 
Non-Smokers 

Nut Proteins
Nutrients

Orlistat

Pea Proteins 
Poultry Proteins

Resveratrol 

Screen Time 
Shellfish Proteins
Solanales 

מספר מונחים הם בעלי חשיבות לעוסקים בתזונה, כמו פירוט מדויק של סוגי חלבונים מהחי ומהצומח. כמו כן מופיעים כעת במאגר נוטריינטים מרכזיים במחקר כגון רסרבטול וליקופן. מונחים שימושיים לטיפול השוטף כמו Body-Weight Trajectory או Gestational Weight Gain. ומונחים רלוונטיים נוספים כמו Orlistat או Screen Time.

השינוי המשמעותי ביותר נרשם בקטגוריית סוגי הפרסומים, עם הוספתן של סקירות שיטתיות כסוג פרסום ב – MeSH.  גם עד כה הופיעו סקירות שיטתיות ברשימת סוגי הפרסומים, אך הן היו שם במעמד מיוחד כפילטר ולא כמונח MeSH. כפילטר הן עדין מופיעות בדף של Clinical Queries.


בהוספתן  של  הסקירות השיטתיות לקטגורית סוגי הפרסומים ב – MeSH  נעשתה היסטוריה קטנה, כאשר לראשונה הוסף האינדקס גם למאמרים שפורסמו בעבר. בדרך כלל, מונחי MeSH חדשים מתווספים רק למאמרים חדשים. 
בין סוגי הפרסומים החדשים שהוספו ניתן למנות מספר סוגי קטלוגים ומילונים, פרפרינטים ואפילו פרמקופאה הומאופטית. מושג מענין מהבחינה המידענית שהוסף לרשימת המונחים הוא Gray Literature. 
בסך הכל נוספו השנה למאגר 421 מונחים ו – 20 סוגי פרסומים. נראה מה יביא איתו העדכון הבא!


איך אפשר להשתמש במונחים הללו באופן מעשי?

מונחי MeSH משמשים ליצירת האינדקס של כל המאמרים במדליין. כלומר אם נבצע חיפוש בעזרת מלים אלה נוכל לקבל את כל המאמרים שפורסמו בנושא. אפשר לבצע חיפוש כל פעם לפי הצורך, או להרשם להתראה שבאופן אוטומטי תעדכן אותנו בכל פרסום של מאמר רלוונטי חדש.
איך לבצע חיפוש עם מונחי MeSH? להלן סרטון קצר שמדגים זאת כאן בקישור
איך להרשם להתראות על החיפוש? להלן סרטון קצר שמדגים זאת כאן בקישור

לסיכום: MeSH?  - כדאי להשתמש!

יום שישי, 19 בינואר 2018

MeSH 2018 - מה חדש?

כבכל שנה, מתעדכן מאגר המלים המבוקרות של מדליין - MeSH (ראשי התיבות של Medical Subject Headings). מונחים חדשים נוספים, מונחים אחרים נמחקים או מתעדכנים, והשנה גם עוד מספר חידושים. מה כוללים העדכונים של 2018? את פירוט כל השינויים ניתן לראות כאן בקישור.

חידושים במונחים


מונחים שנמחקו או שונו

113 מונחים נמחקו או שונו. כאן בקישור ניתן לראות את המונחים ששונו ואת המונחים העדכניים יותר שהחליפו אותם (106 סה"כ), וכן את אלה שנמחקו. לדוגמה, מונח שימושי שהופך להיות פופולרי יותר ויותר ועודכן השנה  Glycosylation End Products, Advanced הפך ל -Glycation End Products, Advanced.

מונחים חדשים

השנה נוספו למאגר 471 מונחים (Headings) חדשים, וכן 3 סוגי פרסומים חדשים (Publication Types).
סוגי הפרסומים החדשים הם Adaptive Clinical TrialEquivalence TrialExpression of Concern. פירוט מלא על סוגי הפרסומים החדשים ומשמעותם ניתן לראות כאן.

מבין 471 המונחים החדשים לשנת 2018 בחרתי מספר מונחים מעניינים. את הרשימה המלאה ניתן לראות כאן.

Academic Failure , Academic Performance, Academic Success
Bedridden Persons
Cancer Survivors, Integrative Oncology,  Psycho-Oncology 
Child, Adopted, Child, Foster
Cigar Smoking, Cigarette Smoking, Cocaine Smoking, Pipe Smoking 
Clinical Deterioration
Composting, Conservation of Water Resources, Greenhouse Gases
Diet, High-Protein 
Diet, High-Protein Low-Carbohydrate 
Dietary Approaches To Stop Hypertension
Dietary Exposure 
Dietary Sugars, Sugars 
Diverticular Diseases 
Fascism,  Political Activism, Refugee Camps 
Fermented Foods 
Food Addiction
Food Intolerance 
Healthy Aging 
Night Eating Syndrome
Noncommunicable Diseases 
Obesity Management 
Semantic Web,  Virtual Reality, Wearable Electronic Devices 
Serum Albumin, Human
Shift Work Schedule
Smokers,  Smoking Prevention, Smoking Reduction, Smoking Water Pipes 
Solitary Kidney

עיון ברשימה יכול לרמז על תחומי מחקר בולטים ותופעות משמעותיות של השנים האחרונות, הבאים לידי ביטוי בפרסומים המדעיים העדכניים.  אז מה אפשר לראות ברשימה המדגמית שבחרתי?  בין היתר מונחים הקשורים לתפקוד אקדמי, הרחבה של מונחים הקשורים באונקולוגיה, ועוסקים בטיפול באנשים ששרדו את המחלה ובטיפולים אינטגרטיביים. עוד בולטת הרחבה ופירוט של מונחים רבים הקשורים בעישון, בין היתר דיוק בסוג העישון, כמו סיגריה/סיגר/נרגילה, ומונחים הקשורים למניעת עישון והפחתת עישון. איכות הסביבה גם זוכה להתייחסות עם מונחים כמו יצירת קומפוסט וגזי חממה.
בתחום התזונה אפשר לציין מספר מונחים מעניינים שנכנסו לראשונה לרשימה, ובראשם דיאטת DASH, שנכנסה באיחור אופנתי, כ - 20 שנה לאחר שהמחקר בו הוטבע לראשונה המושג התפרסם. 
עוד בתחום התזונה ניתן לראות הכנסה של המונח דיאטה רבת חלבון, עם תת מונח ספציפי יותר דיאטה רבת חלבון ודלת פחמימות. ההגדרות של סוכרים וסוכרים מהתזונה זוכות לפירוט ודיוק לעומת הקיים בשנים קודמות.
בתחום התנהגויות אכילה ניתן לראות התייחסות לאכילה לילית, התמכרות למזון וטיפול בהשמנה. גם המחקר הרב בתחום של בריאות עובדי משמרות בא כאן לביטוי.
בתחום הגסטרו אפשר לראות התייחסות לאי סבילות למזונות, תוך הדגשת ההבדל מרגישות למזונות, וכן הוספה של מונח למחלה דיברטיקולרית. 
גם הטרנד של מזונות מותססים זוכה להתייחסות בעדכון של הרשימה, וכך גם התקדמות הטכנולוגיה עם הרשת הסמנטית, מציאות מדומה ומכשירים אלקטרוניים לבישים. תופעות עולמיות כמו מחנות פליטים גם ניתן לראות ברשימה, ולסיום מונח שהופתעתי קצת לראות נכנס לפאבמד - פאשיזם.


סוג חדש של Supplementary Records

במאגר MeSH קיימים מספר סוגים של מונחים:
Descriptors (Headings)
Qualifiers (subheadings)
Supplementary Records-Supplementary Chemical Records(SCRs)
פירוט על האיפיונים של כל אחד מסוגי המונחים ניתן לקרוא כאן. החידוש של 2018: סוג חדש של SCRs נוסף, העוסק בוירוסים ואורגניזמים נוספים, ומתעדכן מדי יום לפי הצורך. 

MeSH on Demand: גרסה 2


https://meshb.nlm.nih.gov/MeSHonDemand


MeSH on Demand  הוא כלי של MeSH  המאפשר להכניס טקסט כלשהו (למשל אבסטרקט), ולקבל רשימה של מונחי MeSH רלוונטיים. מתאים למשל לחיפוש של מאמרים דומים למאמר קיים שמצאנו או כתבנו ושאינו מופיע במדליין. השנה יצאה גרסה 2 של הכלי, הכוללת מספר שיפורים שהוצעו על ידי המשתמשים.

איך זה עובד?

מכניסים את הטקסט הרצוי לחלונית החיפוש (עד 10,000 תוים, באנגלית בלבד), ולוחצים על Search. במסך שמתקבל לאחר החיפוש המלים המרכזיות  התואמות למונחי MeSH בטקסט מודגשות, לצד המסך מופיעה רשימה  של מונחי MeSH הרלוונטיים עם קישורים לפירושים שלהן ומיקומן בהיררכיה של MeSH, ומתחת לטקסט רשימה של מאמרים דומים. כמו כן קיימת אופציה לבחור מבין המונחים שהתקבלו את הרלוונטיים ביותר ולהריץ באמצעותם חיפוש חדש בפאבמד.
חשוב להדגיש כי בניגוד להוספת מונחי MeSH למאמרים במדליין, הנעשית בידי אדם, התהליך כאן הוא  אוטומטי Machine-generated by MTI . הכלי  MTI) Medical Text Indexer) נוצר עבור האנשים היוצרים את האינדקס ב - NLM על מנת להקל מעט את עבודתם ולהציע מונחים מתאימים, והוא פתוח גם לשימוש הציבור.
שורה תחתונה: לגמרי מגניב! נסו ותהנו.
מידע כללי נוסף על MeSH ניתן לראות בסרטון הבא.

יום ראשון, 15 בינואר 2017

MeSH: גרסת 2017

כמדי שנה בחודש דצמבר מתפרסם העדכון של (MeSH (Medical Subject Headings, התזאורוס של מאגר המידע הרפואי מדליין/פאבמד. העדכון משקף בין היתר את ההתפתחות והשינויים בתחום הביו רפואי, כפי שהם באים לידי ביטוי בספרות הרפואית המכוסה על ידי מדליין, הכוללת 5400 עיתונים בתחום.
את הרשימה המלאה של המונחים שעודכנו השנה אפשר למצוא כאן.
בחרתי מתוך 627 המונחים שברשימה כ - 50 מונחים מהמעניינים יותר לדעתי, שהמוביל הוא ללא ספק שוקולד (מסומן באדום ברשימה). שימושי מאוד הולך להיות כל הנראה Medically Unexplained Symptoms ...

Some of the New MeSH Headings for 2017


Allergists 
Physicians specializing in treating individuals with hypersensitivity to ALLERGENS.

Anti-Vaccination Movement
Group activities directed against VACCINATION. 

Apartheid
A former political system in SOUTH AFRICA which enforced segregation in all forms, including physical, political, legal and economic discrimination, against all non-white, non-European racial groups. 

Bifidobacterium bifidum 
A species of Bifidobacterium that occurs in the human GASTROINTESTINAL TRACT, especially in infants, and in FERMENTED DAIRY PRODUCTS. It produces BACTERIOCINS and is used as a PROBIOTIC.

Buttermilk 
A beverage made from cow's milk fermented by LACTIC ACID-producing bacteria, especially LACTOCOCCUS LACTIS and LACTOBACILLUS BULGARICUS.

Cardiac Rehabilitation
 Restoration of functions to the maximum degree possible in a person or persons suffering from a CARDIOVASCULAR DISEASE. It also includes cardiac conditioning and SECONDARY PREVENTION in patients with elevated cardiovascular risk profile. 

Cardiologists
Qualified medical professionals who specialize in preventing and treating disorders of the heart and CARDIOVASCULAR SYSTEM.

Cardiorespiratory Fitness 
A measure of the functional capabilities of the heart, lungs and muscles, relative to the demands of specific exercise routines such as running or cycling.

Chocolate
Food product prepared from fermenting, roasting, and grinding the seeds of the COCOA plant.

Diet, Carbohydrate Loading 
A diet rich in DIETARY CARBOHYDRATES. 

Dioxins and Dioxin-like Compounds 
A group of toxic chemical compounds that share chemical structures and biological characteristics that are related to the potent carcinogen 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin.

Endocrinologists 
Physicians who specialize in treating ENDOCRINE SYSTEM DISEASES.

Epidemiologists 
Qualified medical professionals who study the causes, incidence, and characteristic behavior of disease outbreaks or other health-related conditions and determine the interrelationships of hosts, agents, and environment related to the distribution and control of diseases.

Fitness Trackers 
Devices used for measuring physical activity as an indication of HEALTH STATUS

Gardens 
Places provided for the cultivation and/or display of PLANTS.

Gastroenterologists 
Physicians who specialize in treating diseases of the DIGESTIVE SYSTEM.

Gene Editing 
Genetic engineering techniques that involve DNA REPAIR mechanisms for incorporating site-specific modifications into a cell's genome.

Geriatricians 
Physicians specializing in physiological and pathological aspects of aging and the aged, including the clinical problems of senescence and senility

Global Burden of Disease 
Measure of the burden of disease using the disability-adjusted-life-year (DALY). This time-based measure combines years of life lost due to premature mortality and years of life lost due to time lived in states of less than full health. The metric was developed to assess the burden of disease consistently across diseases, risk factors and regions. 

Healthy Diet 
Dietary patterns which have been found to be important in reducing disease risk.

Healthy Lifestyle 
A pattern of behavior involving LIFE STYLE choices which ensure optimum health. Examples are eating right; maintaining physical, emotional, and spiritual wellness, and taking preemptive steps against communicable diseases.

Kefir 
A beverage made from milk fermented by a mixture of endogenous LACTIC ACID-producing yeast and bacteria (KEFIR GRAINS), many of which are PROBIOTICS. It should not be confused with KAFFIR LIME or KAFFIR CORN

Latent Autoimmune Diabetes in Adults 
Autoimmune diabetes in adults with slowly progressive PANCREATIC BETA CELL failure and the presence of circulating autoantibodies to PANCREATIC ISLETS cell antigens. 

Mastic Resin 
Dried tree sap from the MASTIC TREE that is used in TRADITIONAL MEDICINE and chewed as gum.

Medically Unexplained Symptoms 
Persistent health symptoms which remain unexplained after a complete medical evaluation. A cluster of symptoms that consistently appear together but without a known cause are referred to as a MEDICALLY UNEXPLAINED SYNDROME (MUS).

 Mentoring 
The art and practice of training, guiding, COUNSELING, and providing support to a less experienced, trained, or knowledgeable person.

Moral Status
A philosophical description of intrinsic self-worth and dignity which bestows basic rights of life, liberty, and freedom from harm.

Multiple Chronic Conditions 
Two or more concurrent chronic physical, mental, or behavioral health problems in an individual.

Mycobiome 
The full spectrum of FUNGI that exist within a particular biological niche such as an organism, soil, a body of water, etc. 

Nephrologists 
Qualified medical professionals who specialize in treating KIDNEY DISEASES.

Neurologists 
Qualified medical professionals who specialize in treating NERVOUS SYSTEM DISEASES.

Nurse Specialists 
Nursing professionals whose practice is limited to A particular area or discipline of medicine. 

Oncologists 
Physicians specializing in MEDICAL ONCOLOGY or its sub-specialties of RADIATION ONCOLOGY or SURGICAL ONCOLOGY

Pediatricians 
Qualified medical professionals specializing in maintaining health and providing medical care to children from birth through adolescence. 

Provitamins 
Precursor forms of vitamins.

Sexual Minorities 
Individuals including lesbian, gay, bisexual, transgender, queer, intersex, gender non-conforming people, and other populations whose sexual orientation or GENDER IDENTITY and reproductive development is considered outside cultural, societal, or physiological norms.

Sports and Recreational Facilities 
Places designed, built, or installed for LEISURE ACTIVITIES outside of the home

Stair Climbing 
Ascending or descending stairs. 

Stroke Rehabilitation 
Restoration of functions to the maximum degree possible in a person or persons suffering from a stroke.

Struvite 
The mineral magnesium ammonium phosphate with the formula NH4MgPO4. It is associated with urea-splitting organisms in a high magnesium, high phosphate, alkaline environment. Accumulation of crystallized struvite is found in the urinary tract as struvite CALCULI and as scale on sewage system equipment and wastewater pipes.

Urologists 
Physicians specializing in the diagnosis, and treatment of diseases of the urinary tract in both sexes, and the genital tract in the male.

Vaccination Refusal 
Refusal to receive VACCINATION.

Work-Life Balance 
The optimal arrangement of an individual’s on-the-job and private time to facilitate health and personal satisfaction without negatively impacting productivity and professional success.



https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh  מעודכן בכל שנה 


מגמות בעדכון של MeSH

מבין המלים שבחרתי אפשר להצביע על מספר מגמות מעניינות בעדכון לשנה זו:

התמחויות רופאים

תחת המונח Physicians הוכנסו מספר רב של התמחויות שלא היו קיימות קודם לכן.

חיסונים

נושא מתן חיסונים ובעיקר ההתנגדות לכך מקבלים ביטוי עם מונחים כמו Vaccination Refusal ו - Anti-Vaccination Movement.

שעות עבודה ופנאי

העומס המאפיין את החיים המודרניים מקבל ביטוי עם הכנסת המונח Work-Life Balance.  

פעילות גופנית ואורח חיים בריא

מונחים רבים שהוכנסו קשורים לפעילות גופנית ואורח חיים בריא, כמו Stair Climbing , Sports and Recreational Facilities ועוד.

מיקרוביום

מונחים רבים הקשורים לנושא הלוהט  - המיקרוביום - ניתן לראות ברשימה, כמו פירוט רב יותר של חיידקי המיקרוביום, מזונות המבוססים על חלב מותסס (למשל קפיר), והמילה מיקרוביום בעצמה.

תזונה 

בתחום התזונה ניתן לראות ביטוי למחקר הרב בנושא כמות הפחמימות בדיאטה עם המונח Diet, Carbohydrate Loading, הכנסת מונח מיוחד לתזונה בריאה, וכמובן - השוקולד!

מה המשמעות של הכנסת מונחים חדשים ל - MeSH

כל מונח שקיים ב- MeSH, מאפשר לעשות חיפוש ממוקד במאגר על פי משמעותו של המונח ומאפיינים נוספים של החומר המבוקש (סוג המחקר, מונחים חותכים ועוד), זאת בניגוד לחיפוש על פי מלים שיש לעשות על מושגים שאינם מוגדרים ב - MeSH. 
MeSH מתעדכן כאמור מדי שנה בחודש דצמבר, והעדכון משקף את השינויים והחידושים בתחומים אותם הוא מכסה. כך למשל בשנת 2015 נכנס ל - MeSH המונח  Diet, Paleolithic ובאופן די מפתיע נכנס המונח Diet, Vegan  רק בעדכון של 2016. קודם לכן נכלל המושג טבעונות תחת הגדרה רחבה של צמחונות.
מכאן למשל עולה השאלה איך מבצעים חיפוש דרך MeSH על המונח טבעונות? איך מתייחסים למה שהיה עד 2015 ואיך מחפשים החל מ -2016? סרטון שפורסם  על ידי מרכז ההדרכה של הספריה הלאומית לרפואה מסביר מה משמעות התאריכים המופיעים בערכים של MeSH וכיצד יש להתייחס אליהם בעת ביצוע חיפוש. לצפיה בסרטון לחצו כאן.
הרחבה נוספת בנושא משמעות התאריכים של הכנסת מונחים ל - MeSH ניתן לראות כאן בסרטון (עד דקה 20).
סרטון נוסף ומקיף (11 דקות - מומלץ!) על MeSH ניתן לראות כאן.

איך עושים חיפוש באמצעות MeSH

על הדרך בה ניתן לעשות חיפוש במדליין באמצעות MeSH ניתן ללמוד ממספר מקורות:
סרטון קצר (3 דקות) כאן בקישור
הסבר מפורט מפוסט קודם כולל סרטונים כאן בבלוג
פוסט נוסף על החיפוש דרך MeSH כאן מהבלוג
סרטון מורחב (כשעה) עם מידע כללי על MeSH כאן בקישור

אם הגעתם עד לכאן: תודה שקראתם! 

יום חמישי, 7 ביולי 2016

כבר לא ילד: פאבמד חוגג 20 !

מאגר המידע פאבמד חוגג 20 שנה! ולנו יש בהחלט סיבה לחגוג ביחד איתו ולאחל לו אריכות ימים. להלן ההודעה הרשמית על האירוע.
קצת סטטיסטיקות:


מתוך מצגת מאי 2016


מה מייחד את פאבמד?

בניגוד למאגרי מידע מדעיים אחרים בגישה חופשית ברשת, בהם איתור החומר הוא בעזרת מנועי חיפוש אוטומטיים בעיקר (דוגמת גוגל סקולר למשל), פאבמד הוא מאגר העשוי בעבודת יד של אנשי מקצוע, וניתן לעשות בו חיפוש המונחה על ידי משמעות הטקסט. אולי כאן המקום להגיד מילה טובה לממשל האמריקאי המאפשר גישה חופשית מכל העולם לאתר הזה, שהחל כפרויקט ניסויי בינואר 1996 (השנה בה סיימתי את לימודי התזונה בפקולטה...) והגיע עד הלום.


חוגג 20!

MeSH - משמעות השנים ועוד

MeSH הוא מאגר מילות המפתח של מדליין (המאגר העיקרי מבין המאגרים המרכיבים את פאבמד), המשמש ליצירת אינדקס של כל מאמר ומאמר המופיע בו. החיפוש באמצעות MeSH הוא שיטתי ויעיל, ונותן תוצאות מדויקות בהשוואה לחיפוש במנוע חיפוש אוטומטי.
MeSH מתעדכן מדי שנה בחודש דצמבר, והעדכון משקף את השינויים והחידושים בתחומים אותם הוא מכסה. כאן בקישור מידע על העדכונים שנעשו בדצמבר 2015. כך למשל בשנת 2015 נכנס ל - MeSH המונח  Diet, Paleolithic ובאופן די מפתיע נכנס המונח Diet, Vegan  רק בעדכון של 2016. קודם לכן נכלל המושג טבעונות תחת הגדרה רחבה של צמחונות.
מכאן למשל עולה השאלה איך מבצעים חיפוש דרך MeSH על המונח טבעונות? איך מתייחסים למה שהיה עד 2015 ואיך מחפשים החל מ -2016? סרטון שפורסם לאחרונה על ידי מרכז ההדרכה של הספריה הלאומית לרפואה מסביר מה משמעות התאריכים המופיעים בערכים של MeSH וכיצד יש להתייחס אליהם בעת ביצוע חיפוש. לצפיה בסרטון לחצו כאן.
סרטון נוסף ומקיף (11 דקות - מומלץ!) על MeSH ניתן לראות כאן.


מידע נוסף על פאבמד ו - MeSH

מידע נוסף על חיפוש יעיל בפאבמד, חיפוש באמצעות MeSH, שמירת מאמרים, קבלת התראות על חיפושים, פילטרים אישיים ויצירת ביבליוגרפיה עם My NCBI קראו כאן.
מידע על הספרים שניתן לקרוא בפאבמד קראו כאן.

ספרים - גם בפאבמד



מזל טוב ואריכות ימים לפאבמד!!

יום שני, 7 בספטמבר 2015

איך אומרים את זה? 5 כלים לבניית רשימת מילות מפתח

מזמינה אתכם לחזור יחד איתי לשיעור הראשון בקורס מידענות. נושא השיעור: מילות הקסם. מילות הקסם, הכוונה למילות המפתח, בעזרתן מבצעים את החיפוש. לא יודעת כיצד אתם נוהגים לחפש, אני עד הקורס הייתי פועלת כך: מנסה להיזכר איך אומרים את המונח אותו אני מחפשת באנגלית (כן, הרוב המכריע של החיפושים הם באנגלית). נזכרת/מוצאת מונח אחד, הראשון שעלה דעתי, ומתחילה לחפש מאמרים בעזרתו.
סביר להניח שבעזרת שיטה זו אמצא מאמרים בנושא המבוקש. אך אני עלולה גם לפספס מאמרים רבים, אולי חשובים מאוד מבחינתי, אם במאמרים אלה השתמשו במונח אחר, מונח נרדף למונח בו השתמשתי. לדוגמה, פצעי לחץ: נניח שהשתמשתי במונח  Decubitus Ulcer.  אקבל מאמרים בהם מופיע מונח זה, אך לא מאמרים אחרים העוסקים בנושא, אולי חשובים ומרכזיים, שהשתמשו במונחים נרדפים, למשל  Pressure Ulcers, Pressure Sores ,Bedsores, Bed Sores.
השימוש במספר מילות מפתח/מלים נרדפות חשוב במיוחד כאשר לא מוצאים חומר בנושא המבוקש.
מילות המפתח כשמן הן: פועלות כמו מפתח - ברגע שמצאת את המילה הנכונה, נפתחת הדלת לשפע של חומר רלוונטי. זאת תחת ההנחה הבסיסית שיש בעולם הדיגיטלי בו אנו חיים חומר על כל נושא (כמעט?), והשאלה היא רק אם הצלחנו למצוא אותו או לא.
המסקנה מהאמור לעיל היא, שכל חיפוש צריך להתחיל בבנייה של רשימת מילות מפתח רלוונטיות. איך מוצאים מילות מפתח רלוונטיות? בכך עוסק פוסט זה.

א. שימוש בתזאורוס

מהו תזאורוס? תזאורוס הוא אוצר מילים מבוקר לצורך מפתוח ואחזור מידע. התזאורוס כולל עבור כל מילת מפתח (Descriptor) הפניה למילים הנרדפות שלה, וכן מילים בעלות משמעות הפוכה, מונחים רחבים יותר, מונחים צרים יותר ומונחים קשורים.
התזאורוס משמש את ממפתח המידע ואת מחפש המידע כאחד. מטרת התזאורוס, בשונה ממילון, הוא למצוא את המונח המתאים עבור מושג ולא את פירושו. להלן תמונה שמציגה בפשטות מהו תזאורוס מתוך וובינר שנערך על ידי הצוות של מאגר המידע ERIC, שעוד יוזכר בהמשך.


תמונה 1.מהו תזאורוס. מתוך הוובינר של ERIC חלק 2



תזאורי העוסקים בתחומי התזונה והרפואה

לצורך איתור מלים נרדפות בתחום הרפואי, יש להשתמש בתזאורי (Thesauri , צורת הרבים של תזאורוס Thesaurus) העוסק במפתוח מלים בתחום זה. להלן 3 תזאורי העוסקים במישרין או בעקיפין בנושאי רפואה ותזונה.

1. MeSH

(MeSH (Medical Subject Headings הוא התזאורוס של הספריה הלאומית לרפואה בארצות הברית (NLM), המשמש ליצירת האינדקס של המאמרים מתוך 5400 עיתונים רפואיים במאגר מדליין/פאבמד. 
מילות המפתח ב -MeSH מסודרות באופן היררכי, המסייע לאתר מונחים ברמות שונות של ספציפיות. נכון לשנת 2015 מצויות ב - MeSH  לפחות 27,455 מילות מפתח , ולפחות 220,000 מלים נרדפות (Synonymes).
בתמונה 2  ניתן לראות לדוגמא את הדף של המונח פצעי לחץ ב -MESH. במורד הדף, תחת הגדרת המונח ורשימת מונחי משנה ניתן לראות (מסומן בצהוב) את רשימת ה -Entery Terms, שהם למעשה המלים הנרדפות של פצעי לחץ. כאשר רוצים לעשות חיפוש בנושא כלשהו, מומלץ לחפש את הדף של המונח המתאים ב -MESH, ולבדוק מהן המלים הנרדפות שלו. דרך דף זה ניתן גם לבצע את החיפוש בפאבמד, ובמלים הנרדפות שבו  ניתן להשתמש גם במנועי חיפוש אחרים.
למידע נוסף על MESH, כיצד להשתמש בו וכיצד ניתן לבצע דרכו את החיפוש בפאבמד קראו כאן



תמונה 2. המונח פצעי לחץ כולל המלים הנרדפות ב -MESH




2. NAL Agricultural Thesaurus

התזאורוס של הספריה הלאומית לחקלאות בארצות הברית נמצא פתוח לשימוש ברשת משנת 2002, ומתעדכן מדי שנה בינואר. הוא כולל למעלה מ - 110,000 מונחים, המופיעים הן באנגלית והן בספרדית.
כל מונח מופיע עם מלים נרדפות, מושגים קשורים ומונחים רחבים יותר וצרים יותר (במידה ויש).
התזאורוס מאורגן לפי 17 קטגוריות נושאים שונות, בהן גם לדוגמה Food and Human Nutrition.
ניתן לחפש מונחים בגלישה לפי נושאים או לפי סדר אלפאביתי, או להקליד מלים במנוע החיפוש של התזאורוס. אפשרויות אלה מודגשות בצהוב בתמונה 3.


תמונה 3. דף הבית של התזאורוס של הספריה הלאומית לחקלאות. מספר אפשרויות חיפוש


התזאורוס מופעל באופן אוטומטי בחיפוש בפורטל PubAg, ומומלץ להשתמש בו גם להעשרת רשימת מילות המפתח בעת בניית חיפוש  למאגרי מידע אחרים.
בתמונה 4 מובא לדוגמה הדף של Kidney Transplant בתזאורוס. ניתן לראות את מגוון המלים הנרדפות, וכן מושג רחב יותר, מושג קשור, הגדרה של המונח, ולאיזו קטגוריה הוא שייך בתזאורוס. עוד מודגש בתמונה 4 בצד ימין קישור לגוגל סקולר, עליו ניתן ללחוץ על מנת לקבל חיפוש ישיר של המונח במנוע חיפוש זה.


תמונה 4. המושג Kidney Transplant בתזאורוס


3. ERIC

ERIC הוא קיצור שמו של Education Resources Information Center.  זהו מאגר דיגיטלי אונליין של מידע ומחקרים בחינוך, הקיים כבר למעלה מחמישים שנה. במאגר למעלה מ - 1.5 מליון מאמרים, דיווחים, סיכומי כנסים, ספרים ועוד. למעלה מ - 323,000 פריטים המצויים ב -ERIC הם בטקסט מלא, ונעשה מאמץ להגדיל את מספרם בצורה משמעותית. מאות פריטים חדשים מוספים מדי יום, 4000 פריטים בחודש.  אמנם זהו מאגר בנושא חינוך, אך נושאים רבים בו משיקים גם לתזונה, למשל השפעת ארוחת הבוקר על הישגי התלמידים, תוכניות חינוך בתזונה או הפרעות אכילה. 
הסיבה שאני מזכירה כאן את ERIC היא קיומו של תזאורוס עשיר המשמש למפתוחו. התזאורוס מכיל למעלה מ -11,000 מונחים בתחום החינוך. לאחרונה קיים צוות המאגר וובינר מקיף שעסק כולו בתזאורוס שלו. חלקים מומלצים במיוחד להאזנה מהוובינר: 
חלק 1 מדקה 6 - מסביר מהו תזאורוס וכיצד הוא בנוי.
חלק 3 מדקה 5.15 - מסביר איך התזאורוס מסייע להתחלה של החיפוש או לצמצום התוצאות.
מידע נוסף על ERIC כולל סרטוני הדרכה והסבר על השימוש בתזאורוס אפשר לקרוא כאן

ב. PubMed Health

PubMed Health הוא מאגר מידע בנושאי רפואה הקיים משנת 2013,  ומכיל מידע רב, המותאם הן לאנשי מקצוע והן לציבור הרחב. הוא אינו מוגדר כתזאורוס, אך ניתן למצוא בו עבור חלק מהמונחים מלים נרדפות ומונחים קשורים. תחת הלשונית Health  A to Z, הנמצאת בתפריט Content שבדף הבית (מוצג בתמונה 5), מרוכז מידע רב על מושגים רפואיים שונים. ניתן להגיע לכל מושג בגלישה לפי סדר אלפביתי (מודגש בתמונה 6), או דרך מנוע החיפוש המצוי בכל דף של המאגר (מודגש בתמונות 5 ו -6). בתמונה 7 ניתן לראות לדוגמה את הדף המוקדש לאבני כליה. בנוסף להגדרת המונח ולאוסף מאמרים בנושא, המצויים בדף הראשי, ניתן לראות מצד ימין גם מלים נרדפות (Also Called) ומונחים קשורים (Other terms to know).

תמונה 5. דף הבית של PubMed Health



תמונה 6. דף הבית של Health A To Z. חיפוש אלפביתי או דרך מנוע החיפוש



תמונה 7. הדף של אבני כליה ב -PubMed Health



ג. מחוכמת ההמונים - ויקיפדיה כתזאורוס

גם הערכים בויקיפדיה יכולים לתרום להעשרת רשימת מילות המפתח. ערכים רבים בויקיפדיה כוללים בתחילתם מספר אפשרויות למלים נרדפות עבור המושג הנדון. ניתן למשל לחפש את המונח בעברית לפי הנוחיות, ואז לעבור לדף באנגלית (קישור בתפריט מצד ימין - דף זה בשפות אחרות - מסומן בתמונה 8), ולקבל רשימת מלים אפשריות. לדוגמה בתמונה 9 - הדף של הסולניים - כולל מילה שימושית לחיפוש - Nightshades - שאינה כלולה למשל במלים הנרדפות של הסולניים    ב -MeSH. דבר זה ממחיש את הצורך לבדוק תמיד במספר מקורות מידע לקבלת תמונה מלאה יותר.


תמונה 8. ויקיפדיה כמקור למלות מפתח

תמונה 9. סולניים בויקיפדיה באנגלית


לסיכום, את החיפוש הבא מומלץ להתחיל בבניה של רשימת מילות מפתח רלוונטיות. כדאי להיעזר לצורך כך בכלים שהוזכרו לעיל. במהלך החיפוש וקריאת המאמרים מוצאים בדך כלל מלים נוספות, כדאי להוסיף אותן לרשימה ולהשתמש בהן לפי הצורך בהמשך. נסו ולא תצטערו!

יום חמישי, 2 ביולי 2015

כן תדברו על ERIC

מהו  ERIC?

ERIC הוא קיצור שמו של Education Resources Information Center.
ERIC הוא מאגר מידע שבהחלט כדאי להכיר. אולי עוד לא שמעתם עליו, אבל הוא כבר לא ילד: בשנת 2014 מלאו לו חמישים! למתעניינים בהיסטוריה ERIC יש כאן מצגת מפורטת.
ERIC הוא מאגר דיגיטלי אונליין של מידע ומחקרים בחינוך. במאגר למעלה מ - 1.5 מליון מאמרים, דיווחים, סיכומי כנסים, ספרים ועוד. למעלה מ - 323,000 פריטים המצויים ב -ERIC הם בטקסט מלא, ונעשה מאמץ להגדיל את מספרם בצורה משמעותית. מאות פריטים חדשים מוספים מדי יום, 4000 פריטים בחודש. מספר צפיות הדף היומי ב -ERIC הוא 110,000.
ERIC ממומן ומתופעל על ידי המכון למדעי החינוך במשרד החינוך האמריקאי (the Institute of Education Sciences, U.S. Department of Education), אולם 50% מהמשתמשים בו הם מחוץ לארצות הברית.
למידע נוסף על  ERIC, כולל רשימת העיתונים והמקורות האחרים אותם הוא מכסה, קראו כאן.


תמונה 1: הממשק של ERIC


איך מחפשים ב - ERIC?

מידע כללי על ERIC ועל אופן החיפוש בו ניתן לראות בסרטון הבא.
כפי שמוסבר בסרטון, ברוב המקרים אין צורך בחיפוש מתקדם לקבלת תוצאות מתאימות. במידת הצורך, ניתן לקרוא כאן על הדרכים ליצירת חיפוש מתקדם.

חיפוש באמצעות התזאורוס

במאגר יש תזאורוס, המאפשר לעשות חיפוש מדוייק יותר. התזאורוס מתעדכן כל חמש שנים. ניתן לגלוש בו לפי נושאים, או לעשות חיפוש של מונחים מסוימים. ניתן גם לבצע חיפוש במאגר ישירות מהתזאורוס בדומה ל -MESH של PUBMED. נכנסים לתזאורוס בלחיצה על המילה תזאורוס, המופיעה בצמוד לחלונית החיפוש בדף הראשי ומודגשת בצהוב התמונה 2. ניתן לראות בתמונה שהטקסט בחלונית החיפוש התחלף מ - Search Education Resources  ל - Search Thesaurus Descriptors. כמו כן מימין לחלונית החיפוש מופיע כעת  קישור המאפשר לגלוש בין קטגוריות התזאורוס. בחלונית החיפוש ניתן לחפש מונחים ישירות בתאורוס.

למידע נוסף על התזאורוס של ERIC ניתן לצפות בוובינר שהוקדש לנושא באוגוסט 2015.
תמונה 2: חלון התזאורוס של ERIC

ERIC  - לא רק לעוסקים בחינוך!

גלישה בין מונחי התזאורוס מגלה שניתן למצוא חומרים רבים שנוגעים למשל לקשר בין תזונה וחינוך, כמו תוכניות קידום בריאות, השפעת ארוחת הבוקר על הישגי התלמידים, או הפרעות אכילה. ניתן לראות דוגמה לנושא רלוונטי  ונקודת פתיחה טובה לגלישה בתזאורוס של ERIC עבור תזונאים למשל מסומנת בתמונה 3.

גלישה בתזאורוס וחיפוש מלים ומלים נרדפות למונחים מסוימים עשויה לעזור גם בחיפוש במנועי חיפוש שאין בהם תזאורוס, כמו גוגל סקולר , גוגל, יאהו, או בינג.




תמונה 3: גלישה בתזאורוס של ERIC, מומלץ לנסות את הקטגוריה  Health and Safety


ממשיכים להתעדכן

עדכונים על ERIC לשנת 2015 ניתן לראות בסרטון הבא.
וברוח ימים אלה, ניתן ומומלץ לעקוב אחר חידושים במאגר ביוטיוב, פייסבוק וטוויטר.

יום שישי, 26 ביוני 2015

Ag for Agriculture

בינואר 2015 הושק מנוע חיפוש חדש של הספריה הלאומית לחקלאות, המאפשר לציבור גישה נוחה וללא תשלום לפרסומים המדעיים של החוקרים במשרד החקלאות האמריקאי.  את הודעת ההשקה של מנוע החיפוש ניתן לקרוא כאן.
מנוע החיפוש נקרא PubAg. השם דומה ל - PubMed, אך מדגיש את ייחודו של המאגר לנושאי חקלאות. קיימת חפיפה מסויימת בין שני המאגרים, אך קיימים ב -PubAg מאמרים שלא יופיעו ב -PubMed.
עבור תזונאים זהו מאגר חשוב מאוד, היות וכל נושא התזונה, בטיחות המזון ואיכות המזון בארצות הברית נמצאים תחת משרד החקלאות.

PubAg מכסה מעל 40,000 מאמרים מעיתונים מדעיים שנכתבו על ידי חוקרים של משרד החקלאות מהשנים 1997 עד 2015.  כל המאמרים של חוקרי משרד החקלאות נמצאים כאן בטקסט מלא בחינם.
בנוסף למאמרים אלה, מכסה מנוע החיפוש גם למעלה מ -  450000 מאמרים בנושאים הקשורים לחקלאות מעיתונים מדעיים שעברו ביקורת עמיתים (Peer Reviewed), בעיקר מהשנים 2002-2012. מאמרים חדשים מוספים מדי יום, כ -20,000 מדי חודש. גם מאמרים ישנים יותר (מאמרים שפורסמו לפני 1997) יוספו בהמשך במידת האפשר.
השקת הפורטל הינה בשני שלבים, כאשר הראשון היה כאמור בינואר השנה, והשני מתוכנן לסוף שנת 2015. בשלב השני יתווספו למאגר מאמרים רבים נוספים, וכן כלי עזר  לחיפוש ומעקב אחרי שאילתות החיפוש.



תמונה 1: דף הבית של PubAg


כלי עזר לחיפוש ב -PubAg

עקרונות החיפוש במאגר מוסברים ב - PubAg FAQs.
ניתן להשתמש באופרטורים AND, OR, NOT , בחיפוש המתקדם לפי שדות ספציפיים, ולהיעזר בפילטרים לסינון התוצאות בצד שמאל של דף התוצאות.

NALT: the NAL Thesaurus

החיפוש ב -PubAg מתבצע באופן אוטומטי תוך שימוש בתזאורוס (מאגר מילות המפתח) של הספריה הלאומית לחקלאות. כלומר, כאשר מכניסים מילת חיפוש מסוימת הקיימת בתזאורוס, החיפוש יתבצע גם למלים הנרדפות שלה, בדומה לחיפוש ב -PubMed. אופן החיפוש והדרכים לצמצם או להרחיב את התוצאות מוסבר כאן
ניתן לראות איזה חיפוש נעשה בחלונית Search Details המסומנת בצהוב בתמונה 2. כמו כן מסומן הקישור  Refine my search, עליו יש ללחוץ על מנת להרחיב או לצמצם את המונחים עליהם מתבצע החיפוש. 

תוצאות החיפוש ב - PubAg


כאן לא קיימת בשלב זה האפשרות לחפש ישירות מהתזאורוס , כפי שקיים דרך MeSH ב - PubMed. אולם שימוש נוסף שכן ניתן לעשות בתזאורוס זה: איתור מילות מפתח שונות עבור חיפושים במאגרים אחרים כמו גוגל סקולר. קישור ישיר לגוגל סקולר אגב כן קיים ישירות מהתזאורוס של הספריה לחקלאות, אך הוא מחפש רק את המונח עצמו ולא את כל המונחים הנרדפים והקשורים. בתמונה 3 מסומן לדוגמה המונח Diet Recall, המונחים הנוספים שיופיעו בחיפוש ב -PubAg, והמקום ללחוץ למעבר ישיר לגוגל סקולר. שם כאמור, יתבצע חיפוש רק על Diet Recall.


תמונה 3

בהמשך השנה צפוי לצאת לפועל השלב השני של PubAg, מענין יהיה לראות אילו שרותים נוספים ואיזו הרחבה של החומר המכוסה על ידו נקבל. כדאי לעקוב!

יום שישי, 22 במאי 2015

MESH - כדאי להשתמש

מחפשים מידע בתחומי הרפואה והתזונה במאגר המידע פאבמד (PubMed)? מצוין! אצלי למשל הוא הבחירה הראשונה לאיתור מידע רלוונטי בתחום.
פאבמד הוא מאגר המידע של הספריה הלאומית לרפואה בארה"ב. הוא קיים משנת 1996, מכיל מעל 24 מליון מאמרים מעיתונים מדעיים, וכולל בתוכו את מאגר MEDLINE וכן מקורות נוספים, ביניהם מאמרים שטרם פורסמו רשמית, ספרים ומאמרים מ – Pubmed Central. החיפוש במאגר הוא חינם. למידע נוסף על פאבמד קראו כאן.
פאבמד כולל מגוון רחב של אפשרויות חיפוש. הפעם אני רוצה להרחיב על מאגר המידע MESH, ועל הדרך לבצע חיפוש ממוקד בפאבמד דרכו.  
MESH, הקיצור של Medical Subject Headings, הוא מאגר מילות המפתח המשמש ליצירת אינדקס המאמרים בפאבמד. הוא מאפשר לאתר בקלות מאמרים בנושא מסוים, גם אם מחברים שונים משתמשים במושגים שונים לתיאורו (מלים נרדפות).  החיפוש המדויק בדרך זו גם מצמצם למינימום קבלה של תוצאות לא רלוונטיות לנושא החיפוש בו בחרנו. שימוש נוסף למאגר: אוצר המלים המוצג ב -MESH יכול לשמש לאחר מכן גם לחיפוש במאגרי מידע אקדמי אחרים, כמו למשל גוגל סקולר, שאינם מפרסמים רשימת מילות מפתח.

איך מגיעים למאגר MESH?

הגישה למאגר היא דרך דף הבית של פאבמד, תחת More Resources. להלן קישור ישיר למאגר MESH.

איך מחפשים במאגר MESH?

בתמונה 1 ניתן לראות את דף הבית של המאגר. בחלונית החיפוש כותבים את המונח המבוקש. בתמונה 2 ניתן לראות לדוגמה את תוצאת החיפוש עבור המונח Omeg 3 Fatty Acids. לעתים מתקבלים מספר מונחים הקשורים למילת החיפוש, ואז יש לבחור את המתאים ביותר לקבלת דף המונח כפי שמוצג בתמונה 2.


תמונה 1: דף הבית של MESH








תמונה 2: דף המונח של אומגה 3 ב -MESH


בדף המונח ניתן לראות מספר חלקים:
בראש הדף, ממש מתחת לכותרת, מופיעה ההגדרה של המונח. מומלץ לקרוא אותה על מנת לוודא שזה אכן המונח אליו התכוונו.
מתחת להגדרה מופיעה רשימה של מונחי משנה, שיוכלו לשמש אותנו מאוחר יותר לצמצום החיפוש דרך MESH.
בהמשך, במסגרת האדומה, מופיעות כל המלים הנרדפות למונח אומגה 3, שהוכנסו לאינדקס של פאבמד. משמעות הדבר היא, שאם נבצע את החיפוש מכאן, פאבמד יחפש עבורנו את כל המלים הנרדפות בלחיצת כפתור אחת.
בצד ימין למעלה ניתן לראות את PubMed Search Builder. לחיצה על כפתור Add to search builder המופיע מתחתיו תוסיף את המונח אומגה 3 לחלונית החיפוש. לחיצה נוספת, הפעם על כפתור Search PubMed שנמצא מתחתיו, תביא לחיפוש המונח אומגה 3 בפאבמד, עם כל המלים הנרדפות שלו.
ניתן באותו אופן להוסיף מונחים נוספים רלוונטיים לנושא החיפוש, למשל מחלות לב. ברירת המחדל לקשר בין המונחים היא AND, ניתן לשנות זאת ל -OR או NOT.
מידע נוסף והדגמה של אופן החיפוש בפאבמד דרך MESH ניתן לראות בסרטון הבא.
הסבר מפורט על אופן החיפוש ניתן למצוא גם כאן.

מוזמנים להעלות שאלות והערות בהמשך לפוסט, ובעיקר להשתמש בכלי הנהדר הזה!