CoCites - אמור לי מי ציטט אותך ואומר לך מי אתה

התוסף CoCites (להתקנה - לחצו כאן) הוא תוסף חדש לדפדפן, ייעודי לפאבמד, המציג שיטה חדשה לחיפוש מאמרים. בנוסף, ניתן לומר שהוא מוסיף לפאבמד מידע שכד כה לא היה ניתן למצוא בו בצורה ישירה- מספר הציטוטים של כל מאמר. אם כי הוא עדין אינו מראה מי הם המאמרים הללו. קיים נכון להיום לדפדפני כרום, פיירפוקס וספארי.

את התוסף יצרה ד"ר A. Cecile J.W. Janssens. ד"ר Janssens במקור מהולנד, וכעת חוקרת במחלקה לאפידמיולוגיה בבית הספר לבריאות הציבור באוניברסיטת Emory באטלנטה, ארה"ב. עוסקת במחקר בנושא ניבוי גנטי של מחלות. אז איך הגיעה ד"ר Janssens לפיתוח CoCites? לפי מה שהיא מספרת - במקרה!

https://www.cocites.com/

איך זה עובד?

הרעיון עליו מבוססת שיטת הפעולה של התוסף הוא שמאמרים המצוטטים יחד הם מאמרים באותו נושא או נושא דומה. בעת לחיצה על הכפתור המיוחד שנמצא ליד כל מאמר בדף התוצאות של פאבמד עם השימוש בתוסף, נסרקות רשימות הרפרנסים של כל המאמרים המצטטים את המאמר הנבחר. לאחר מכן מוצגת רשימת המאמרים שצוטטו יחד עם מאמר הבסיס (המאמר שעל הכפתור שלידו לחצנו, והוא הבסיס לחיפוש). ככל שהמאמרים צוטטו ביחד יותר פעמים הדמיון ביניהם גבוה יותר. 

אפשרויות נוספות שמציע הכלי, הפתוחות בחינם למי שרושם לפחות משתמש נוסף אחד לאתר נכון להיום:

אפשרות להוריד קובץ אקסל עם התוצאות

אפשרות לחפש עם יותר ממאמר בסיס אחד

אפשרות לסנן את תוצאות החיפוש לפי מידת הדמיון בין המאמרים ולפי מאמרים חדשים יותר

אפשרות לשמור חיפושים

יתרונות וחסרונות

יתרונות

פועל במהירות יחסית לכלים דומים, וכן נמצא כבר בפאבמד ואין צורך לפתוח אתר נוסף כדי להשתמש בו. 

מוסיף מידע על ציטוטים ישירות לפאבמד, מידע שלא קיים בפאבמד בצורה ישירה ללא התוסף.

מציע שיטת חיפוש יעילה ומהירה, שאינה מבוססת על איתור מילות מפתח, דבר שדורש זמן ומיומנות ולעתים לא קל להגדרה. 

חסרונות

פועל רק על מאמרים שכבר צוטטו, ובצורה מיטבית על מאמרים שצוטטו לפחות 20 פעמים. לכן לא מתאים לחיפוש המבוסס על מאמרים חדשים. 

לא מתאים לחיפושים רב תחומיים - עובד רק על פאבמד, הממוקד בתחום הביו-רפואי. 

הורדת תוצאות רק לאקסל נכון להיום.

לא ניתן (נכון לעכשיו?) לראות את רשימת המאמרים המצטטים אלא רק את מספרם.

לקבלת אפשרות מלאה של חיפוש יש להזמין אחרים להרשם עם לינק ייחודי למשתמש.

מידע נוסף

התוסף פורסם לראשונה בנובמבר 2019, ונכון להיום עדין בגרסת Beta. מקור המידע לגבי הציטוטים עליו מתבסס התוסף הוא מקור חדש חופשי לשימוש NIH Open Citation Collection OCC. עוד על הכלי והשוואה לכלים דומים ניתן לקרוא בבלוג של Aaron Tay, ספרן ובלוגר מסינגפור. 

סרטוני הדרכה

לצפיה בסרטון הדרכה קצר על השימוש בכלי לחצו כאן

להדרכה מפורטת יותר על הכלי לחצו כאן

לסיכום

לדעתי כלי שימושי מאוד, נסו ועדכנו מה דעתכם!

PubPeer: post-publication peer review

PubPeer היא פלטפורמה שהושקה לראשונה בשנת 2012. מטרת הפלטפורמה היא לשפר את האיכות של המחקר המדעי באמצעות יצירת אינטרקציה ואפשרות לתגובות על המאמרים לאחר פרסומם, במה שנקרא Post-publication peer review. 

תמונה 1. https://pubpeer.com/

איך זה עובד?

בתיבת החיפוש שבראש דף הבית (תמונה 1)  של PubPeer ניתן לחפש כל מאמר על מנת להגיב או לקרוא תגובות, בתנאי שיש למאמר מזהה דיגיטלי אחד מהבאים:

(digital object identifier (DOI

PubMed ID

ArXiv ID

ניתן להגיב כמשתמש גלוי או אנונימי. התגובות של משתמשים אנונימיים עוברות בדיקה טרם אישורן לפרסום. על מנת לפתוח חשבון גלוי באופן עצמאי יש להיות מחברו של לפחות מאמר אחד. למי שאין פרסומים ורוצה לפתוח חשבון גלוי, ניתן לפנות ישירות למנהלי האתר לפתיחת חשבון. מי שפותח חשבון אנונימי מקבל שם משתמש לפי בחירת האתר, וכן קוד סודי שבאמצעותו הוא מבצע את פרסום התגובה. 

בתגובות למאמרים נכללים גם ציוצים מטוויטר אודות המאמר המדובר, וכן פוסטים מבלוגים ומקורות מידע נוספים המתייחסים למאמר. 

בכל מאמר שמוזכר במאגר יש קישור למאמר המקורי, ואפשרות להרשמה לקבלת התראות על תגובות חדשות (תמונה 2).

תמונה 2. קישור למאמר המקורי והרשמה לעדכון על תגובות חדשות.

תוספים

ל - PubPeer תוסף המתאים לדפדפנים כרום, ספארי ופיירפוקס. בהתקנת התוסף, מקבלים התראה כשפותחים מאמר שלגביו נרשמה תגובה ב - PubPeer. עובד עקרונית בכל מקום ברשת, אך בעיקר בפאבמד ובאתר כתב העת. כמו כן קיים תוסף המתאים לתוכנה לניהול ציטוטים זוטרו. להורדת התוספים לחצו כאן.

Peeriodicals

בשנת 2018 הושק באתר המיזם Peeriodicals, המאפשר לכל מי שמעונין ליצור מעין כתב עת אישי על פי בחירתו. בכתב עת זה אוסף העורך (את/ה) מאמרים על בחירתו, ויכול להוסיף להם הקדמה ותגיות. הקוראים יכולים להרשם לקבלת עדכונים על מאמרים חדשים בכל כתב עת כזה. כתבי העת שנוצרו עד כה מחולקים לפי קטגוריות לאיתור קל יותר שך הנושא הרצוי. 

https://peeriodicals.com/

לסיכום, האתר מספק אפשרות להגיב ולשפר את איכות הפרסומים המדעיים, וכן מאפשר ליצור אוסף פרסומים על פי בחירה אישית. על ההשפעה של PubPeer על עולם המדע אפשר ללמוד בין היתר מפוסטים שנכתבו אודותיה בבלוג Retraction Watch, המסקר מאמרים שהוסרו מהספרות מסיבה זו או אחרת. מענין לעקוב אחריו בשנים הבאות, ונראה שנחיצותו גדולה במיוחד בימים אלה של מגיפת הקורונה, שבהם תהליך בקרת העמיתים טרום הפרסום, אם בכלל מתרחש, הוא במקרים רבים לא מספק. למשל, חיפוש של המונח covid-19 הניב נכון להיום 1452 תגובות במאגר. 

JSTOR - כל הסיבות להתחיל להשתמש בו עוד היום

את הפוסט הנוכחי אני רוצה להתחיל בווידוי קצר - עד לאחרונה לא הכרתי כמעט את מאגר המידע האקדמי JSTOR. הוא אינו נמצא ברשימת המאגרים הנפוצים בשימוש בתחומי המדעים, בהיותו מאגר רב תחומי העוסק גם במדעי הרוח. הגעתי אליו לאחר ששמעתי בדרך אגב על כלי בפיתוח JSTOR Labs - כלי מבוסס בינה מלאכותית שנקרא Text Analyzer, ומאפשר חיפוש מידע על סמך טקסט. הכלי המדובר אכן מענין ושימושי, אך לפני שנפנה להכיר אותו רציתי לשתף במידע שלמדתי אודות JSTOR, ובכלים שימושיים נוספים שקיימים בו. 

קצת רקע על JSTOR

JSTOR הוא מאגר מידע אקדמי רב תחומי הכולל מידע ביותר מ – 75 דיסיפלינות. בתחום הרפואה ניתן למנות את התחומים הבאים : Health Policy, Health Sciences, Public Health. בנוסף ניתן למצוא בו מידע בנושאים כמו כימיה, ביולוגיה, מדעי הסביבה, חקלאות ועוד...

JSTOR מכסה למעלה מ - 2600 כתבי עת, ובימים אלה חצה את רף המאה אלף ספרים דיגיטליים. בנוסף מכסה האתר יותר משני מליון פריטי מידע ראשוני מארבעה מקורות. 

JSTOR הוא חלק מארגון בשם ITHEKA, ארגון ללא כוונת רווח הכולל בתוכו שירותים נוספים כמפורט בתמונה 1. 

תמונה 1. https://www.ithaka.org/

כלים שימושיים ב - JSTOR

חשבון אישי ללא תשלום

JSTOR מאפשר לכל משתמש, גם למי שאין גישה מוסדית למאגר, לפתוח בחינם חשבון אישי (עם פרטי חשבון גוגל). אולי כאן גם המקום לציין שהגלישה והחיפוש באתר הם חופשיים. 

חשבון אישי מאפשר:

• גישה למאמרים שאינם פתוחים: באופן רגיל יש גישה לשישה מאמרים בחודש לבעלי חשבון אישי. כעת בתקופת הקורונה ניתנת גישה חופשית למאה מאמרים (שאינם חופשיים) בחודש, עד 31.12.2020, וככל הנראה גישה זו תוארך עד יוני 2021. 
• אזור אישי לשמירת מאמרים - Workspace.
• שיתוף מאמרים עם אחרים באמצעות המייל ו/או הורדת קבצים לתוכנה לניהול ציטוטים.

חיפוש מתקדם - מתקדם

בחיפוש המתקדם של JSTOR ניתן למצוא תכונה הקיימת בדרך כלל רק במאגרי מידע שהשימוש בהם הוא בתשלום - חיפוש באמצעות Proximity Operators - פקודות חיפוש שמאפשרות לחפש מונחים המצויים במרחק של מספר מלים זה מזה ולאו דווקא צמודים כביטוי או במרחק בלתי מוגדר. ב - JSTOR ניתן להגדיר חיפוש במרחק של  5/10/25 מלים.

Text Analyzer

הכלי שהביא אותי ל - JSTOR  מלכתחילה הוא הכלי שמפותח ב - JSTOR Labs ונקרא Text Analyzer. כלי זה, בדומה לכלים דומים נוספים שמוכרים כיום דוגמת Iris.ai או Mesh on Demand, מנתח את הטקסט שמכניסים אליו, ממצה מתוכו את המונחים העיקריים ומבצע חיפוש של מידע נוסף על סמך מונחים אלה. אנו כמשתמשים נדרשים לספק את הטקסט, ולא לחשוב לבד אילו מילות חיפוש להכניס. 

איך זה עובד?

הגישה ל - Text Analyzer היא מתפריט Tools בדף הבית, והשימוש בו הוא חופשי. הוא עדין בגרסת BETA, הערות יתקבלו על ידי המפתחים בברכה. ניתן לשימוש גם מטלפון חכם.

בחלונית של הכלי יש להכניס את הטקסט שיהווה את הבסיס לחיפוש. ניתן להדביק טקסט או קישור למאמר, או להעלות/לגרור קבצים מסוגים שונים. ניתן להעלות טקסט  ב – 15 שפות! כולל עברית, ערבית, רוסית, ספרדית (תוצאות מתקבלות באנגלית).

לאחר העלאת הטקסט הכלי מעבד אותו וממצה ממנו נושאים, אנשים, מקומות וארגונים. בעזרת נושאים אלה הוא מחפש במידע הקיים ב – JSTOR ומציג את התוצאות. ניתן לשנות ולהוסיף מונחים לחיפוש לפי הצורך, וכן לקבוע מה תהיה מידת ההשפעה של כל מונח על התוצאות. את תוצאות החיפוש ניתן לסנן גם לפי פילטרים של שנים, סוג הפרסום וגישה לטקסט. 

מידע נוסף על הכלי ואופן פעולתו ניתן לקרוא כאן. כמו כן מומלץ לצפות בסרטונים המובאים להלן לקבלת הדרכה נוספת על השימוש בכלי.

מידע נוסף - סרטוני הדרכה

בערוץ היוטיוב של JSTOR יש סרטוני הדרכה על החיפוש באתר ועל השימוש בכלי Text Analyzer. בנוסף ניתן לצפות בהקלטת השידור החי שקיימתי לאחרונה על JSTOR. 

לסיכום, הן המאגר JSTOR והן הכלים שהוא מציע, ובראשם ה - Text Analyzer הם שימושיים, ידידותיים וחופשיים. גם הגישה החופשית למאמרים בתשלום הורחבה מאוד בחסות מגיפת הקורונה. בהיותו מאגר רב תחומי, כל אחד יכול למצוא בו מידע בנושאים המעניינים אותו, וגם מידע הנושק למספר תחומים. מומלץ מאוד להכיר את המאגר, ולהוסיף אותו לארגז הכלים. 

סקולר נגד סקולר (נגד סקולר)

תחום התוספים לדפדפן מתחמם בשני מנועי החיפוש המובילים Semantic Scholar ו - Google Scholar. 

Google Scholar הוציאו עדכון לתוסף, הקיים כבר משנת 2015. ב - Semantic Scholar השיקו בימים אלה לראשונה תוסף לדפדפני כרום ופיירפוקס. 

עדכונים לתוסף של Google Scholar

התוסף של Google Scholar קיבל עדכון גרסה לכבוד יום הולדתו החמישי, וכעת ניתן לעשות באמצעותו כמעט כל מה שניתן לעשות גם מהאתר עצמו, מכל דף אינטרנט שבו נמצאים. בלחיצה על התוסף ניתן לנסות לאתר טקסט מלא של מאמר, לקבל ציטוט מעוצב, לחזור לחיפוש קודם ועוד.

לאחר העדכון החדש ניתן לשמור ישירות מהתוסף מאמרים לספריה האישית ב - Google Scholar, וגם לגשת לספריה האישית. בנוסף, גם בקריאת קובץ PDF מהרשת Google Scholar יזהה את המאמר באתר ויאפשר שמירה שלו, קבלת ציטוט, חיפוש מאמרים דומים ועוד. 

מידע נוסף על העדכון לתוסף ניתן לקרוא בפוסט מהבלוג של  Google Scholar בנושא.

לדעתי תוסף מאוד שימושי, ששווה להתקין אם הוא עוד לא נמצא בדפדפן שלכם (כרום או פיירפוקס). 

תמונה 1. מגוון האפשרויות שנותן התוסף של Google Scholar.

תוסף חדש לדפדפן של Semantic Scholar

במנוע החיפוש Semantic Scholar השיקו לראשונה תוסף לדפדפן, שמקצר את הדרך לאתר מכל דף אינטרנט שבו תהיו. התוסף בגרסתו הראשונה מספק תכונות בסיסיות יחסית לתוסף של Google Scholar: מסמנים קטע מטקסט או כותרת מאמר שפתוח בדפדפן, והתוסף מאפשר לבצע חיפוש עם המקטע המסומן ישירות ב - Semantic Scholar או למצוא את המאמר באתר. לאחר שמגיעים לאתר ניתן לשמור את המאמר בספריה האישית, ליצור Feed מותאם אישית ממנו, וכל יתר התכונות שמציע Semantic Scholar. בחלק מהמקרים לא נדרש לסמן את הכותרת על מנת שהתוסף יזהה אותה, למשל ב - PubMed, ובחלק מהמקרים חייבים לסמן את הכותרת לצורך זיהוייה. 

את ההודעה על ההשקה ניתן לראות כאן. סביר להניח שנראה תכונות נוספות לכלי הזה בהמשך. גם את הגרסה הראשונה שווה להתקין כדי להגיע למאמרים/ליצור חיפושים בקליק ב - Semantic Scholar. 

מי ה - Scholar החדש בשכונה? Internet Archive Scholar

תמונה 2. Internet Archive Scholar

מנוע חיפוש חדש למאמרים בטקסט מלא מבית  Internet Archive  שנקרא  Internet Archive Scholar הושק לאחרונה בגרסת אלפא. הוא מכסה כעת כ - 25 מליון מאמרים בטקסט מלא. פרוייקט נוסף של Internet Archive שנקרא Fatcat מכסה את אותם מאמרים בטקסט מלא,  בתוספת פרסומים להם קיים מטא דאטה (מידע על מידע) בלבד. 

האתר מכסה מאמרים מהמאה ה - 18 ועד היום, וכולל גם כיסוי של מאמרים מכתבי עת בגישה פתוחה שלא ניתן יותר למצוא ברשת במקומות אחרים. יתכן והסיבה להעלמות מאמרים היא קשיים במימון התחזוקה של שרתים וכדומה, אך ייתכן וגם מדובר במאמרים מכתבי עת טורפים (כתבי עת שלא עורכים בקרת עמיתים או בקרה כלשהי למאמרים המפורסמים בהם), וכמו תמיד נכון הכלל של בדיקת כל מאמר לגופו בשאלת באיכות. מידע נוסף ניתן לקרוא כאן.

ותראו מה קורה אם Internet Archive Scholar  לא מוצא כלום בתשובה לשאילתה שלכם? הוא מפנה למנועי ה - Scholar האחרים! לזה אני קוראת שיתף פעולה.

תמונה 3 : ההודעה המתקבלת אם אין תוצאות במנוע החיפוש

אז אם שלושת "הסקולרים" משתפים פעולה, אולי עוד יש סיכוי לשלום עולמי. ובינתיים, נסו את הכלים החדשים ושתפו מה דעתכם!

MeSH on Demand - תמיד לשרותך

תמונה 1. MeSH on Demand

מבוא - על בינה מלאכותית ב - PubMed

כלים מבוססי בינה מלאכותית נכנסים יותר ויותר לשימוש יומיומי במגוון תחומים, וכך גם בתחום מנועי החיפוש. מנוע החיפוש הוותיק לאיתור מידע בתחום הביו-רפואה PubMed עודנו מבוסס בעיקר על טכנולוגיה של בינה אנושית - אחזור מידע באמצעות מילות מפתח שנקבעו על ידי אנשים (מונחי MeSH). אולם גם ב - PubMed יש ניצנים של שימוש בטכנולוגיה של בינה מלאכותית. את השימוש העיקרי בטכנולוגיה זו ניתן לראות בצורת הסידור של תוצאות החיפוש, שכעת היא ברירת המחדל של האתר, הנקראת Best match. Best match הוא אלגוריתם מבוסס בינה מלאכותית, שמבוסס בין היתר על למידה של התנהגות מליוני המשתמשים של האתר, ומטרתו להביא את התוצאות הרלוונטיות ביותר לדף התוצאות הראשון. 

מי אתה MeSH on Demand?

MeSH on Demand הוא כלי נוסף של PubMed המבוסס על בינה מלאכותית. הוא מעט נסתר מן העין, אך ניתן להגיע אליו בקלות מדף הבית של PubMed כמתואר בתרשים 1. הכלי מאפשר להדביק בתוכו טקסט של עד 10,000 תוים (כחמישה עמודים מודפסים), אך ניתן לכתוב בו גם מספר מלים בודדות. מתוך הטקסט שנכניס אליו, יודע MeSH on Demand להדגיש את המלים מתוכו שמתאימות למונחי MeSH קיימים, ולתת הסבר על כל מונח. בנוסף, הוא נותן רשימה של 10 מאמרים המתאימים למונחים הללו  ב - PubMed. 

חיפוש באמצעות MeSH on Demand

אולי החלק הכי שימושי בכלי הוא האפשרות ליצור חיפוש מתוחכם ישירות  ב – PubMed מהמונחים שנמצאו או רחבים יותר. את התהליך מתחילים בלחיצה על הכפתור Start PubMed Search שנמצא מימין לתיבת החיפוש. בלחיצה עליו מתקבל "תפריט" של המונחים שאותרו בחיפוש, ולצידם גם המונחים בעלי המשמעות הרחבה  יותר לשימוש לפי הצורך. מסמנים את המונחים הרצויים לחיפוש ולוחצים על Search in PubMed כמתואר בתמונה 2. 

תמונה 2. בחירת מונחי חיפוש מתוך Mesh on Demand

החיפוש המתקבל ב - PubMed הוא חיפוש מתוחכם, לדעתי אפילו יותר מזה שמתקבל כשעושים חיפוש ב - 

PubMed עצמו. כפי שניתן לראות בפירוט פרטי החיפוש (מהחיפוש המתקדם של PubMed, תמונה 3) כל מונח שבחרנו מופיע עם תוית של MeSH  וגם ללא תוית, שזה מקביל לתוית All Fields בחיפוש הרגיל. אולם אם יש מלים נרדפות , כמו למשל בדוגמה למונח Celiac Disease, הוא מוסיף אותן גם לחיפוש, מה שלא קורה בחיפוש רגיל. שווה!

תמונה 3. פרטי החיפוש המתקבל מחיפוש ב - PubMed דרך Mesh on Demand

איך מגיעים ל - MeSH on Demand ?

הגישה לכלי MeSH on Demand היא דרך דף הבית של PubMed כמתואר בתרשים 1.

תרשים 1. איך מגיעים ל - MeSH on Demand

סרטון הדרכה על השימוש ב - MeSH on Demand

לצפיה בסרטון הדרכה על  MeSH on Demand לחצו כאן או ראו להלן. הסרטון הוא מתוך סדרת השידורים החיים בנושאי מידענות "ראשון בלייב" בקהילה לא מחפשים.מוצאים מדי יום ראשון בשעה 21:00. מוזמנים להצטרף! 

מידע גנטי פלוס

 על פי הודעת הספרייה הלאומית לרפואה, NLM, החל מ - 1.10.2020 יוסר מהרשת האתר Genetics Home Reference. 

המידע מאתר זה יופיע כעת באתר MedlinePlus באזור ייעודי תחת השם  MedlinePlus Genetics. המידע שהועבר כולל פירוט על מעל 1300 מצבים גנטיים, מעל 1400 גנים, וכן ספר הדרכה בשפה פשוטה על תחום הגנטיקה. פירוט נוסף על המידע שקיים כעת ב - MedlinePlus Genetics ניתן לקרוא כאן. 

האתר MedlinePlus מיועד קודם כל לציבור הרחב, אולם גם אנשי מקצוע בתחום הרפואה והמידע יכולים ליהנות מהשימוש בו. כמקובל באתרים של הספריה הלאומית לרפואה, NLM, קיימים קישורים בין מקורות המידע שהיא מספקת בכל אתר ואתר. כך למשל בדף מידע על מחלה מסויימת ניתן למצוא קישורים למחקרים קליניים בתחום מאתר ClinicalTrials.gov, חיפוש מוכן בצורה מקצועית וממוקדת בפאבמד בלחיצת כפתור, רשימה של מלים נרדפות למונח ומקורות מידע נוספים. דוגמה לכך ניתן לראות למשל בדף על  Glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency בסעיף Additional Information & Resources.

גנטיקה ב - MedlinePlus

לסיכום, אתר הכולל מידע רב ערך, הן לציבור הרחב והן לאנשי מקצוע, ממקורות מבוססים עליהם ניתן להסתמך. המעבר למיקום החדש יהפוך את המידע לנגיש יותר, היות ואתר MedlinePlus הוא אתר ידוע הנמצא בשימוש רב, ועל כל כן נראה שהעברת המידע אליו היא צעד מבורך.

Vivli - פלטפורמה לשיתוף מידע גולמי ממחקרים קליניים

Vivli, ארגון ללא כוונת רווח,  השיק לפני כשנתיים (יולי 2018), פלטפורמה גלובלית שמטרתה לקדם את המחקר בתחום הרפואה על ידי שיתוף מידע ממחקרים קליניים ברמת הנחקר הבודד.  המטרה היא לאפשר שימוש חוזר בנתוני הנחקרים על מנת לאפשר מחקרים בזמן קצר יותר תוך ניצול המשאבים ממחקרים קליניים שכבר הסתיימו. 

הארגון המייסד של Vivily הוא -

  The Multi-Regional Clinical Trials Center of Brigham and Women’s Hospital and Harvard 

https://vivli.org/

התוכן ב - Vivily

פירוט מלא של הסטטיסטיקות של הפלטפורמה ניתן לראות כאן. נכון להיום כוללת הפלטפורמה מידע על יותר משלושה מליון נבדקים ומעל 5400 מחקרים. שלושת הנושאים המבוקשים ביותר בחיפוש אחר נתונים הם איך לא וירוס הקורונה החדש, ואחריו מחלת האלצהיימר ומחלת הסוכרת. 28 גופים נמנים נכון להיום בין התורמים של המידע לפלטפורמה, בהם חברות תרופות ומרכזי מחקר.

החיפוש ב - Vivily ותהליך העבודה על הנתונים

ניתן לחפש מחקרים ב - Vivli בשלוש דרכים - על פי מספר המחקר אם הוא ידוע, לפי מילות מפתח, או באמצעות חיפוש מובנה על פי מונחי PICO. מונחי החיפוש המבוקרים המשמשים להרחבת או צמצום החיפוש באמצעות PICO הם פרי שיתוף פעולה בין Vivli ל - Cochrane. 

לאחר איתור המחקר/ים המתאימ/ים יש להגיש בקשה לקבלת הנתונים. לצורך כך יש לפתוח חשבון חינמי באתר. בטופס הבקשה ממלאים פרטים על המחקר המתוכנן להתבצע. במידה ומתקבל אישור לשימוש בנתונים, מקבלים גישה לפלטפורמה מאובטחת בה ניתן לפתוח את הקבצים ולבצע בהם ניתוחים סטטיסטיים. הפלטפורמה מאפשרת גם גישה לתוכנות סטטיסטיות נפוצות. את הנתונים לא ניתן להוריד מהפלטפורמה, אלא אם מתקבל אישור נוסף מיוחד לכך, לאחר שמוודאים שנמחק כל פרט מזהה אפשרי של משתתפי המחקר המקורי. 

סרטון קצר, המסביר את אופן החיפוש בפלטפורמה ואת אופן הגשת הבקשה לקבלת הנתונים והעבודה איתם, ניתן לראות כאן. תיאור גרפי של התהליך ניתן לראות כאן. 

לסיכום, נראה כי למיזם של Vivli פוטנציאל אמיתי של קידום המחקר ברפואה באמצעות הנגשת נתוני מחקר, שעד כה לא היו פתוחים למחקר העולמי. למרות שנושא השיתוף של נתוני מחקר באופן פתוח הולך וצובר תאוצה בימים אלה, באתרים דוגמת Figshare או Dryad, בפלטפורמה של Vivli ניתן למצוא נתונים גולמיים איכותיים שלא פתוחים במקומות אחרים.