שפיות סמנטית: עדכונים מ - Semntic Scholar

מנוע החיפוש המבוסס בינה מלאכותית Semntic Scholar  נמצא בתנופת פיתוח משמעותית בימים אלה. לאחר שעלה לרשת בשנת 2015 עם כיסוי של 3 מליון מאמרים בתחומי הרפואה והמחשבים, כיום הוא מכסה מעל 178 מליון מאמרים בתחומי מחקר רבים. את מגוון תחומי המחקר ניתן לראות, ואף לבחור את התחום הרצוי לחיפוש, בלחיצה על התפריט הנפתח לצד תיבת החיפוש כמוצג בתמונה 1. עוד חידוש  שימושי במאגר: כיסוי רחב יותר של מאמרים בטקסט מלא באמצעות שיתוף פעולה עם Unpaywall.

תמונה 1: תחומי המחקר המכוסים על ידי Semantic Scholar

עדכון של פרופיל חוקר

ב - Semantic Scholar קיימים פרופילי חוקרים, אותם מייצר המאגר באופן אוטומטי. כעת ניתן לפנות לצוות הפיתוח על מנת לתקן ולהוסיף פרטים ומידע לפרופיל כמוצג בתמונה 2.

תמונה 2: אפשרות לעדכון פרופיל החוקר במאגר

תוספי תזונה ותרופות - כלי מבוסס בינה מלאכותית לגילוי האינטרקציות ביניהם

ב - Semantic Scholar ממשיכים לתמוך בעולם הרפואה, ומגייסים את טכנולוגית הבינה המלאכותית לגילוי אינטראקציות בין תרופות לתוספי תזונה בכלי חדש שהושק לאחרונה במאגר, ונקרא Supp.ai. הגישה לכלי היא מדף הבית של Semantic Scholar. בתיבת החיפוש יש להקיש את שם התרופה או התוסף הרצויים, ובתוצאות החיפוש מתקבלת רשימה של אינטרקציות אפשריות עם תרופות ותוספי תזונה אחרים. לצד כל תוסף או תרופה המופיעים ברשימה קיים קישור לרשימת המאמרים ממנה נלקח המידע.

תמונה 3. Supp.ai

שפיות סמנטית - עדכונים מותאמים אישית

כלי נוסף שהושק לאחרונה, ונמצא עדין בגרסת בטא, נקרא "שפיות סמנטית" או כפי שמופיע באתר: Semantic Sanity: A Personalized Research Feed. כלי זה מאפשר לבצע חיפוש חופשי ו/או לבחור מתוך קטגוריות נושאים מוגדרות. מתוך תוצאות החיפוש המתקבלות מסמנים אילו מאמרים הם המתאימים למה שרצינו על ידי לחיצה על הכפתור More like this המופיע מתחת לכל מאמר ברשימת התוצאות. לאחר שמסמנים לפחות מאמר אחד ניתן ליצור ולשמור רשימת מאמרים בנושא, ולצד כל מאמר שיופיע שם לסמן אם הוא מתאים יותר או פחות. לפי המידע שנספק, רשימת המאמרים שנקבל תהיה מותאמת טוב יותר לצורך שלנו.

נכון להיום כלי זה הוא כאמור עדין בגרסת בטא, וכן מבוסס על מאגר  Arxiv בלבד (מאגר של מאמרים בגישה פתוחה בניהול אוניברסית קורנל, בעיקר בתחומי הפיזיקה, מתמטיקה ומחשבים) . בנוסף, הוא מוגבל למאמרים מחמש השנים האחרונות בלבד. סביר להניח שבקרוב יורחב הכיסוי למאגרים ותחומים נוספים.

תמונה 4. https://s2-sanity.apps.allenai.org/cold-start

לסיכום, נראה כי הצוות של Semantic Scholar בראשותו של פרופ' אורן עציוני לא נח לרגע, מענין אילו עוד חידושים מחכים מעבר לפינה... שווה לעקוב!

המשרד (ODS) לשירותך: כל מה שרצית לדעת על תוספי תזונה. חלק 4: הפילטר המיוחד של פאבמד לתוספי תזונה

בפרק הרביעי והאחרון העוסק במקורות מידע לאנשי מקצוע מאתר ODS רציתי להפנות את תשומת הלב לפילטר מיוחד לנושא של תוספי תזונה המצוי בפאבמד, וקצת נחבא מן העין.
את הפרקים הקודמים בסדרה ניתן לקרוא כאן.
הפילטר, הנקרא Dietary Supplement Subset, הינו פרי של שיתוף פעולה בין ODS לבין הספריה הלאומית לרפואה NLM. הפילטר מאפשר להגביל את החיפושים בפאבמד לחלק של המאגר העוסק בתוספי תזונה בלבד.

איך משתמשים בפילטר של תוספי התזונה?

הפילטר של תוספי תזונה אינו נמצא בדרך כלל בפילטרים המופיעים כברירת מחדל לאחר כל חיפוש בפאבמד בצד שמאל של המסך. לכן במספר פעולות פשוטות מוסיפים אותו לפאנל הפילטרים.

שלב 1 : הוספת הפילטר Subjects לרשימת הפילטרים

הפילטר של תוספי תזונה שייך לקטגוריה הנקראת Subjects. לכן ראשית יש להסיף קטגוריה זו לרשימת האפשרויות. לאחר ביצוע חיפוש כלשהו, לוחצים על Show additional Filters  ובוחרים את Subjects כמתואר בתמונה 1, בדוגמה על חיפוש בנושא מגנזיום. 

תמונה 1: הוספת פילטר Subjects לפאנל הפילטרים

שלב 2: הוספת האפשרות של Dietary Supplements בתוך Subjects

לאחר שהוספנו את הפילטר  Subjects, יש להוסיף בתוכו את Dietary Supplements כמתואר בתמונה 2.  

תמונה 2: הוספת Dietary Supplements  

שלב 3: בחירת הפילטר Dietary Supplements

לאחר שהוספנו את הפילטר, כל שנותר לעשות הוא ללחוץ עליו, ולקבל תוצאות חחיפוש ממוקדות בנושא של תוספי תזונה. ניתן כמובן להוסיף פילטרים אחרים הצורך.

תמונה 3: בחירת הפילר של תוספי תזונה

מידע נוסף

מידע נוסף על הפילטר, כולל דוגמאות לשימוש, ניתן לקרוא כאן. בנוסף, אם אתם לא רוצים להוסיף לבד את הפילטר, תוכלו לבצע את החיפוש ישירות מתיבת החיפוש שכאן, ופאבמד יוסיף לכם אוטומטית את הפילטר של תוספי תזונה.
ואם כבר משתמשים בפילטרים המצויים תחת Subjects, שימו לב לפילטרים מעניינים נוספים כמו סרטן, איידס או ההיסטוריה של הרפואה, אולי גם הם יהיו לכם לעזר.

המשרד (ODS) לשירותך: כל מה שרצית לדעת על תוספי תזונה. חלק 3- DSLD: אלפי תוויות בכף ידך

הסוף לסיורים של סטאז'רים/דיאטנים בבתי המרקחת לאיסוף נתונים על תוספי תזונה? הסוף לבקשה מהמטופלים להביא לקליניקה את תוספי התזונה שהם לוקחים? איתור מהיר של תוסף תזונה מתאים לפי הקטגוריה הרצויה? כל זאת ועוד בפרק השלישי על האתרים המיועדים לאנשי מקצוע באתר ODS.
בפרקים הקודמים : פרק 1 על הפרקטיקום השנתי בנושא תוספי תזונה, ובחלק השני על האתר DSID הבודק את הרווח שבין התכולה הרשומה לזו שבפועל בתוספי תזונה נפוצים.

בפוסט הנוכחי נתוודע לאתר (DIETARY SUPPLEMENT LABEL DATABASE (DSLD.
זהו אתר שנוצר בשיתוף פעולה בין ה - NIH ו - ODS לטובת חוקרים, אנשי מקצועות הבריאות וגם לציבור הרחב. האתר מציג את כל המידע הקיים על תויות תוספי התזונה הנמכרים בארה"ב. רלוונטי גם אלינו היות ומוצרים רבים מארה"ב מיובאים לכאן, על ידי הרשתות או באופן אישי על ידי הצרכנים.

https://dsld.nlm.nih.gov/dsld/index.jsp

מה באתר?

האתר DSLD מביל מידע על יותר מ - 2000 מוצרים, 200 יצרנים ו - 100 רכיבים של תוספי התזונה.
בדף הבית יש הפניה לחיפוש  לפי יצרן, רכיב תזונה או שם המוצר.
כמו כן יש הפניה למידע לפי חיפושים נפוצים: מוצרים לנשים בהריון ומניקות, מוצרים לילדים ומוצרים לקשישים.
לכל תוסף תזונה המופיע במאגר מוצגת תמונה של התוית המופיעה על אריזת המוצר. אך גדולתו של המאגר הנוכחי היא הרבה מעבר: מנגנון החיפוש שבאתר מאפשר חיפוש בתוך המידע שעל התוית, וביצוע חיתוכים מסוגים שונים. אפשר למשל בחיפוש המתקדם לחפש לפי ההצהרות של המוצר, ולקבל את כל המוצרים שרשום עליהם "טבעוני" או "ללא גלוטן" או "בריא ללב" (או שלושתם..). ניתן לחפש לפי רכיב מסויים (למשל ארגינין) או לפי קטגוריית רכיבים (למשל חומצות אמינו).
ניתן גם להוריד את המידע כקובץ אקסל.

הפניה למקורות מידע נוספים

כפי שמקובל באתרים רבים של NIH, גם כאן יש הפניה מתוך האתר למידע נוסף ממאגרי מידע אחרים של הארגון. אם נכנסים למידע על מוצר מסוים, בלשונית   Dietray supplement Facts מופיעה רשימה של רכיבי המוצר. כל רכיב הוא למעשה גם קישור, המוביל למידע נוסף עליו, מאתרים דוגמת פאבמד, מדליין פלוס או ClinicalTrials. שימושי במיוחד לרכיבים פחות מוכרים כמו מיני פטריות... הנה כאן קישור לדוגמה.

סרטון הדרכה

מידע נוסף והדגמה של השימוש באתר בסרטון המומלץ של רשת הספריות הרפואיות בארה"ב שפורסם לאחרונה.

לסיכום

מאגר מעולה על תוספי תזונה לשימושים רבים: מחקריים, טיפוליים ועוד...

מידע תרופתי מבית טוב: One Stop Shop

Drug Information Portal

פרט לפאבמד ומדליין הידועים, מתחזקת הספריה הלאומית לרפואה בארה"ב (NLM) עוד מגוון אתרים קצת פחות ידועים, אך איכותיים לא פחות. בפוסט קודם סקרתי את האתר  Genetics Home Reference העוסק במידע גנטי, ומותאם הן לאנשי מקצוע והן לציבור הרחב. הפעם אני רוצה לספר על אתר, המהווה מעין פורטל למקורות מידע רבים בנושא תרופות ותוספי תזונה, מקורות של NLM ואתרי ממשל נוספים.
האתר Drug Information Portal מבית הספריה הלאומית לרפואה (NLM) הוא למעשה One Stop Shop (כפי שמגדיר הסרטון המצורף להלן) עבור מידע תרופתי.
במרכזו של דף הבית ניתן לראות חלונית חיפוש, בה אפשר להכניס את שם התרופה (גנרי או מסחרי), או שם של קבוצת תרופות. ניתן למצוא כאן מידע גם על תוספי תזונה. אם לא הקלדתם את השם במדוייק יציע לכם האתר מספר שמות דומים לבחירה.

https://druginfo.nlm.nih.gov/drugportal/

בדף תוצאות החיפוש מתקבל מידע ממספר רב של מקורות (של NLM ואתרי ממשל נוספים דוגמת FDA), והכל בלחיצת כפתור. מידע זה כולל בין היתר:
רקע כללי על התרופה ומידע רפואי רלוונטי (מהאתר מדליין פלוס)
ניסויים קליניים על התרופה (מאתר Clinical Trials)
מאמרים על התרופה (מפאבמד/מדליין/פאבמד סנטרל)
סקירות שיטתיות על התרופה (Pubmed Health)
מידע על התרופה מאתר FDA
מידע על התרופה בהריון והנקה (מאתר LactMed)
מידע על זיהוי התרופה (מאתר PillBox)
מידע מהיצרן של התרופה (מאתר DailyMed)

לא בכל תרופה מופיעים כל המקורות, להלן דוגמה לדף תרופה המכיל את רובם.

תוספי תזונה

האתר Drug Information Portal מספק כאמור מידע גם על תוספי תזונה, ומצטרף לאתר המצויין של NIH, הקרוי  Office of Dietary Supplements, שעבר מתיחת פנים לפני כשנה ומכיל אזור שלם עם מידע לאנשי מקצוע.

הפלוס שבמדליין - מדליין פלוס

מדליין פלוס https://medlineplus.gov/ הוא אתר בנושאי רפואה ובריאות של משרד הבריאות האמריקאי - NIH. האתר קיים משנת 1998, ומתוחזק על ידי הספריה הלאומית לבריאות NLM, הספריה הרפואית הגדולה בעולם. האתר פונה לציבור הרחב, וכתוב בשפה פשוטה וברורה. המידע באתר עדכני ומבוסס על מקורות מידע מהימנים, כך שהן הציבור והן אנשי מקצוע יכולים למצוא בו שימוש רב. מידע נוסף על האתר כולל סרטון קצר ניתן לראות כאן. עוד על מדליין פלוס ניתן ללמוד מקטע קצר מתוך סרטון על מקורות מידע בתזונה מדקה 18:08 עד דקה 20.

תמונה 1. מדליין פלוס - מציין כיסוי של 1000 נושאי בריאות באתר. פברואר 2017

מידע בנושאי בריאות Health Topics

מקור המידע העיקרי באתר הוא דפי מידע בנושאי בריאות מגוונים תחת הקטגוריה Health Topics בדף הבית. בעת עליית האתר לאוויר בשנת 1998 היו בו 22 דפי מידע בנושאי בריאות, ולאחרונה ציינו באתר מעל 1000 דפים כאלה. למעלה ממאה מבין דפים אלה עוסקים בנושאי תזונה ומזון.

מה כולל כל נושא

כל דף בנושא מסוים כולל מידע רב, כפי שמסוכם בחלקו העליון כמוצג בתמונה 2, לדוגמה על הנקה. בנוסף לסיכום קצר על הנושא הנידון ניתן למצוא גם חדשות אחרונות והפניה לנושאים קשורים.
בקטגוריית Reasearch  ניתן למצוא מידע שרלוונטי אולי יותר לאנשי מקצוע (מודגש בצהוב): הפניה למחקרים רלוונטיים באתר Clinical Trials, והפניה למאמרים רלוונטיים בפאבמד. תחת Journal Articles ניתן לראות 3 מאמרים אחרונים, ולחיצה על see more articles תעביר אותנו לפאבמד, עם שאילתה מובנה מראש. השאילתה, שנבנתה על ידי אנשי מקצוע, נותנת מספר יחסית מצומצם של מאמרים רלוונטיים. לחיפושים המובנים ניתן להגיע גם ישירות מדף הבית של פאבמד תחת Topic-Specific Queries. הסבר על כך ניתן לראות בסרטון הבא מדקה 23:41 עד דקה 26. מידע נוסף על חיפושים מוכנים מראש ניתן לראות כאן.
בכל דף קיים גם קישור לעדכוני RSS בנושא (מודגש בצהוב מצד ימין). מידע נוסף על עדכוני RSS ניתן לראות כאן.

תמונה 2. הפניות למידע בראש כל דף של Health Topics

מדליין פלוס - מידע שימושי נוסף

1. מידע על תוספי תזונה ותרופות.
2. מידע רפואי בשפות שונות כולל רוסית וערבית. 
3. עדכונים שוטפים של חדשות בריאות
4. אנציקלופדיה רפואית ומילון רפואי
5. אפשרות להרשמה מפורטת ביותר לעדכוני RSS
6. פודקסט שבועי עם עדכונים מחדשות הרפואה (קישור תחת Videos & Tools)